Protein–RNA interactions for Protein: P0DJ93

SMIM13, Small integral membrane protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM13P0DJ93 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM13P0DJ93 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM13P0DJ93 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM13P0DJ93 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM13P0DJ93 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM13P0DJ93 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM13P0DJ93 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM13P0DJ93 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM13P0DJ93 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM13P0DJ93 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM13P0DJ93 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM13P0DJ93 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM13P0DJ93 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM13P0DJ93 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM13P0DJ93 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM13P0DJ93 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM13P0DJ93 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM13P0DJ93 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM13P0DJ93 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM13P0DJ93 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM13P0DJ93 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM13P0DJ93 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM13P0DJ93 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM13P0DJ93 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM13P0DJ93 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM13P0DJ93 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM13P0DJ93 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM13P0DJ93 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM13P0DJ93 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM13P0DJ93 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM13P0DJ93 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM13P0DJ93 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM13P0DJ93 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM13P0DJ93 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM13P0DJ93 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM13P0DJ93 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM13P0DJ93 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM13P0DJ93 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM13P0DJ93 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM13P0DJ93 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM13P0DJ93 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM13P0DJ93 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM13P0DJ93 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM13P0DJ93 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM13P0DJ93 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM13P0DJ93 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM13P0DJ93 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM13P0DJ93 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM13P0DJ93 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM13P0DJ93 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM13P0DJ93 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM13P0DJ93 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM13P0DJ93 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM13P0DJ93 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM13P0DJ93 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM13P0DJ93 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM13P0DJ93 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM13P0DJ93 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM13P0DJ93 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM13P0DJ93 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM13P0DJ93 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM13P0DJ93 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM13P0DJ93 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM13P0DJ93 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM13P0DJ93 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM13P0DJ93 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM13P0DJ93 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM13P0DJ93 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM13P0DJ93 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM13P0DJ93 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM13P0DJ93 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM13P0DJ93 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM13P0DJ93 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMIM13P0DJ93 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMIM13P0DJ93 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMIM13P0DJ93 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMIM13P0DJ93 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMIM13P0DJ93 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMIM13P0DJ93 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM13P0DJ93 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM13P0DJ93 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM13P0DJ93 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM13P0DJ93 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM13P0DJ93 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM13P0DJ93 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM13P0DJ93 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM13P0DJ93 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM13P0DJ93 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM13P0DJ93 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM13P0DJ93 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM13P0DJ93 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM13P0DJ93 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM13P0DJ93 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM13P0DJ93 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM13P0DJ93 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM13P0DJ93 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM13P0DJ93 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM13P0DJ93 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM13P0DJ93 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM13P0DJ93 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms