Protein–RNA interactions for Protein: P0CF97

FAM200B, Protein FAM200B, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM200BP0CF97 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM200BP0CF97 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM200BP0CF97 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM200BP0CF97 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM200BP0CF97 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM200BP0CF97 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM200BP0CF97 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM200BP0CF97 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM200BP0CF97 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM200BP0CF97 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM200BP0CF97 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM200BP0CF97 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM200BP0CF97 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM200BP0CF97 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM200BP0CF97 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM200BP0CF97 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM200BP0CF97 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM200BP0CF97 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM200BP0CF97 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM200BP0CF97 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM200BP0CF97 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM200BP0CF97 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM200BP0CF97 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM200BP0CF97 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM200BP0CF97 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM200BP0CF97 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM200BP0CF97 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM200BP0CF97 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM200BP0CF97 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM200BP0CF97 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM200BP0CF97 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM200BP0CF97 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM200BP0CF97 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM200BP0CF97 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM200BP0CF97 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM200BP0CF97 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM200BP0CF97 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM200BP0CF97 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM200BP0CF97 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM200BP0CF97 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM200BP0CF97 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM200BP0CF97 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM200BP0CF97 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM200BP0CF97 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM200BP0CF97 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM200BP0CF97 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM200BP0CF97 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM200BP0CF97 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM200BP0CF97 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM200BP0CF97 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM200BP0CF97 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM200BP0CF97 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM200BP0CF97 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM200BP0CF97 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM200BP0CF97 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM200BP0CF97 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM200BP0CF97 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM200BP0CF97 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM200BP0CF97 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FAM200BP0CF97 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FAM200BP0CF97 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FAM200BP0CF97 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FAM200BP0CF97 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FAM200BP0CF97 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FAM200BP0CF97 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FAM200BP0CF97 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM200BP0CF97 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM200BP0CF97 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM200BP0CF97 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM200BP0CF97 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM200BP0CF97 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM200BP0CF97 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM200BP0CF97 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM200BP0CF97 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM200BP0CF97 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM200BP0CF97 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM200BP0CF97 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM200BP0CF97 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM200BP0CF97 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM200BP0CF97 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM200BP0CF97 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM200BP0CF97 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM200BP0CF97 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM200BP0CF97 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM200BP0CF97 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM200BP0CF97 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM200BP0CF97 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM200BP0CF97 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM200BP0CF97 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM200BP0CF97 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM200BP0CF97 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM200BP0CF97 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM200BP0CF97 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM200BP0CF97 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM200BP0CF97 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM200BP0CF97 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM200BP0CF97 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM200BP0CF97 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM200BP0CF97 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM200BP0CF97 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms