Protein–RNA interactions for Protein: P01033

TIMP1, Metalloproteinase inhibitor 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMP1P01033 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TIMP1P01033 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TIMP1P01033 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TIMP1P01033 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TIMP1P01033 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TIMP1P01033 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TIMP1P01033 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TIMP1P01033 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TIMP1P01033 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TIMP1P01033 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TIMP1P01033 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TIMP1P01033 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TIMP1P01033 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TIMP1P01033 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TIMP1P01033 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TIMP1P01033 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TIMP1P01033 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TIMP1P01033 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TIMP1P01033 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TIMP1P01033 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TIMP1P01033 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TIMP1P01033 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TIMP1P01033 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TIMP1P01033 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TIMP1P01033 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TIMP1P01033 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TIMP1P01033 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TIMP1P01033 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TIMP1P01033 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TIMP1P01033 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TIMP1P01033 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TIMP1P01033 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TIMP1P01033 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TIMP1P01033 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TIMP1P01033 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TIMP1P01033 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TIMP1P01033 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TIMP1P01033 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TIMP1P01033 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TIMP1P01033 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TIMP1P01033 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TIMP1P01033 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TIMP1P01033 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TIMP1P01033 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TIMP1P01033 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TIMP1P01033 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TIMP1P01033 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TIMP1P01033 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TIMP1P01033 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TIMP1P01033 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TIMP1P01033 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TIMP1P01033 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TIMP1P01033 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TIMP1P01033 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TIMP1P01033 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TIMP1P01033 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TIMP1P01033 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TIMP1P01033 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TIMP1P01033 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TIMP1P01033 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TIMP1P01033 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TIMP1P01033 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TIMP1P01033 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TIMP1P01033 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TIMP1P01033 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TIMP1P01033 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TIMP1P01033 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TIMP1P01033 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TIMP1P01033 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TIMP1P01033 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TIMP1P01033 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TIMP1P01033 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TIMP1P01033 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TIMP1P01033 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TIMP1P01033 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TIMP1P01033 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TIMP1P01033 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TIMP1P01033 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TIMP1P01033 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TIMP1P01033 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TIMP1P01033 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TIMP1P01033 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TIMP1P01033 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TIMP1P01033 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TIMP1P01033 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TIMP1P01033 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TIMP1P01033 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TIMP1P01033 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TIMP1P01033 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TIMP1P01033 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TIMP1P01033 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TIMP1P01033 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TIMP1P01033 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TIMP1P01033 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TIMP1P01033 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TIMP1P01033 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TIMP1P01033 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TIMP1P01033 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TIMP1P01033 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TIMP1P01033 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms