Protein–RNA interactions for Protein: O95983

MBD3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3O95983 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MBD3O95983 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MBD3O95983 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MBD3O95983 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MBD3O95983 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MBD3O95983 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
MBD3O95983 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
MBD3O95983 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MBD3O95983 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
MBD3O95983 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MBD3O95983 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MBD3O95983 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MBD3O95983 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MBD3O95983 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MBD3O95983 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MBD3O95983 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MBD3O95983 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MBD3O95983 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MBD3O95983 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
MBD3O95983 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MBD3O95983 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MBD3O95983 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MBD3O95983 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MBD3O95983 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MBD3O95983 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MBD3O95983 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MBD3O95983 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MBD3O95983 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MBD3O95983 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MBD3O95983 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MBD3O95983 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MBD3O95983 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MBD3O95983 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MBD3O95983 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MBD3O95983 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MBD3O95983 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MBD3O95983 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MBD3O95983 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MBD3O95983 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MBD3O95983 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MBD3O95983 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MBD3O95983 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MBD3O95983 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MBD3O95983 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MBD3O95983 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MBD3O95983 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MBD3O95983 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MBD3O95983 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MBD3O95983 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MBD3O95983 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MBD3O95983 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MBD3O95983 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MBD3O95983 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MBD3O95983 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MBD3O95983 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MBD3O95983 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
MBD3O95983 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MBD3O95983 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MBD3O95983 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MBD3O95983 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MBD3O95983 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
MBD3O95983 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MBD3O95983 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
MBD3O95983 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MBD3O95983 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MBD3O95983 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MBD3O95983 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MBD3O95983 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MBD3O95983 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MBD3O95983 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MBD3O95983 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MBD3O95983 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
MBD3O95983 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MBD3O95983 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
MBD3O95983 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MBD3O95983 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MBD3O95983 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MBD3O95983 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MBD3O95983 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MBD3O95983 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MBD3O95983 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MBD3O95983 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MBD3O95983 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MBD3O95983 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MBD3O95983 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MBD3O95983 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MBD3O95983 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MBD3O95983 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MBD3O95983 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MBD3O95983 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MBD3O95983 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MBD3O95983 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MBD3O95983 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MBD3O95983 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MBD3O95983 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MBD3O95983 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MBD3O95983 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MBD3O95983 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MBD3O95983 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MBD3O95983 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms