Protein–RNA interactions for Protein: O95754

SEMA4F, Semaphorin-4F, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4FO95754 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA4FO95754 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA4FO95754 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA4FO95754 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA4FO95754 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA4FO95754 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA4FO95754 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA4FO95754 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA4FO95754 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA4FO95754 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA4FO95754 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA4FO95754 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA4FO95754 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA4FO95754 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA4FO95754 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA4FO95754 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA4FO95754 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA4FO95754 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA4FO95754 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA4FO95754 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA4FO95754 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA4FO95754 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA4FO95754 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA4FO95754 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA4FO95754 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA4FO95754 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA4FO95754 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA4FO95754 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA4FO95754 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEMA4FO95754 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEMA4FO95754 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEMA4FO95754 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEMA4FO95754 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEMA4FO95754 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEMA4FO95754 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEMA4FO95754 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SEMA4FO95754 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SEMA4FO95754 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA4FO95754 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA4FO95754 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA4FO95754 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA4FO95754 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA4FO95754 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA4FO95754 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA4FO95754 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA4FO95754 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA4FO95754 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA4FO95754 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA4FO95754 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA4FO95754 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA4FO95754 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA4FO95754 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA4FO95754 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA4FO95754 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA4FO95754 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA4FO95754 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA4FO95754 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA4FO95754 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA4FO95754 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA4FO95754 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA4FO95754 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA4FO95754 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA4FO95754 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA4FO95754 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA4FO95754 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA4FO95754 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA4FO95754 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA4FO95754 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA4FO95754 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA4FO95754 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA4FO95754 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA4FO95754 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA4FO95754 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA4FO95754 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA4FO95754 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA4FO95754 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA4FO95754 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA4FO95754 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA4FO95754 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA4FO95754 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA4FO95754 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA4FO95754 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA4FO95754 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA4FO95754 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA4FO95754 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA4FO95754 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA4FO95754 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA4FO95754 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA4FO95754 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA4FO95754 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA4FO95754 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA4FO95754 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA4FO95754 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA4FO95754 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA4FO95754 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA4FO95754 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA4FO95754 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA4FO95754 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA4FO95754 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA4FO95754 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms