Protein–RNA interactions for Protein: O75676

RPS6KA4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA4O75676 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
RPS6KA4O75676 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RPS6KA4O75676 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
RPS6KA4O75676 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RPS6KA4O75676 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RPS6KA4O75676 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RPS6KA4O75676 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RPS6KA4O75676 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RPS6KA4O75676 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RPS6KA4O75676 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RPS6KA4O75676 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RPS6KA4O75676 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RPS6KA4O75676 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RPS6KA4O75676 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RPS6KA4O75676 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RPS6KA4O75676 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RPS6KA4O75676 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RPS6KA4O75676 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RPS6KA4O75676 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RPS6KA4O75676 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RPS6KA4O75676 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RPS6KA4O75676 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RPS6KA4O75676 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RPS6KA4O75676 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RPS6KA4O75676 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RPS6KA4O75676 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RPS6KA4O75676 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RPS6KA4O75676 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RPS6KA4O75676 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RPS6KA4O75676 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RPS6KA4O75676 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RPS6KA4O75676 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RPS6KA4O75676 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RPS6KA4O75676 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RPS6KA4O75676 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
RPS6KA4O75676 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RPS6KA4O75676 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RPS6KA4O75676 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RPS6KA4O75676 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RPS6KA4O75676 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RPS6KA4O75676 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RPS6KA4O75676 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
RPS6KA4O75676 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RPS6KA4O75676 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RPS6KA4O75676 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RPS6KA4O75676 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RPS6KA4O75676 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RPS6KA4O75676 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RPS6KA4O75676 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RPS6KA4O75676 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
RPS6KA4O75676 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RPS6KA4O75676 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RPS6KA4O75676 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RPS6KA4O75676 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RPS6KA4O75676 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RPS6KA4O75676 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RPS6KA4O75676 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RPS6KA4O75676 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RPS6KA4O75676 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RPS6KA4O75676 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RPS6KA4O75676 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RPS6KA4O75676 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RPS6KA4O75676 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RPS6KA4O75676 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RPS6KA4O75676 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RPS6KA4O75676 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RPS6KA4O75676 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RPS6KA4O75676 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RPS6KA4O75676 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RPS6KA4O75676 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RPS6KA4O75676 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RPS6KA4O75676 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RPS6KA4O75676 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RPS6KA4O75676 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RPS6KA4O75676 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RPS6KA4O75676 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RPS6KA4O75676 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RPS6KA4O75676 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
RPS6KA4O75676 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
RPS6KA4O75676 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RPS6KA4O75676 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RPS6KA4O75676 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RPS6KA4O75676 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RPS6KA4O75676 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RPS6KA4O75676 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RPS6KA4O75676 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RPS6KA4O75676 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RPS6KA4O75676 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RPS6KA4O75676 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
RPS6KA4O75676 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RPS6KA4O75676 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RPS6KA4O75676 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RPS6KA4O75676 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RPS6KA4O75676 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
RPS6KA4O75676 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
RPS6KA4O75676 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RPS6KA4O75676 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RPS6KA4O75676 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RPS6KA4O75676 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RPS6KA4O75676 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms