Protein–RNA interactions for Protein: O60749

SNX2, Sorting nexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX2O60749 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX2O60749 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX2O60749 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX2O60749 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX2O60749 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX2O60749 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX2O60749 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX2O60749 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX2O60749 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX2O60749 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX2O60749 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX2O60749 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX2O60749 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX2O60749 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX2O60749 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX2O60749 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX2O60749 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX2O60749 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX2O60749 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX2O60749 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX2O60749 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX2O60749 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX2O60749 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX2O60749 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX2O60749 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX2O60749 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX2O60749 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX2O60749 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX2O60749 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX2O60749 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX2O60749 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX2O60749 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX2O60749 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX2O60749 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX2O60749 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX2O60749 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNX2O60749 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNX2O60749 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNX2O60749 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNX2O60749 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNX2O60749 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNX2O60749 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX2O60749 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX2O60749 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX2O60749 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX2O60749 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX2O60749 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX2O60749 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX2O60749 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX2O60749 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX2O60749 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX2O60749 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX2O60749 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX2O60749 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX2O60749 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX2O60749 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX2O60749 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX2O60749 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX2O60749 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX2O60749 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX2O60749 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX2O60749 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX2O60749 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX2O60749 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX2O60749 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX2O60749 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX2O60749 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX2O60749 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX2O60749 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX2O60749 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX2O60749 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX2O60749 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX2O60749 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX2O60749 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX2O60749 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX2O60749 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX2O60749 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX2O60749 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX2O60749 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX2O60749 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX2O60749 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX2O60749 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX2O60749 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX2O60749 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX2O60749 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX2O60749 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX2O60749 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX2O60749 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX2O60749 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX2O60749 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX2O60749 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX2O60749 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX2O60749 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX2O60749 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX2O60749 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX2O60749 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX2O60749 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX2O60749 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX2O60749 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX2O60749 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms