Protein–RNA interactions for Protein: O43896

KIF1C, Kinesin-like protein KIF1C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF1CO43896 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KIF1CO43896 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KIF1CO43896 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KIF1CO43896 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KIF1CO43896 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KIF1CO43896 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KIF1CO43896 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KIF1CO43896 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KIF1CO43896 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KIF1CO43896 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KIF1CO43896 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KIF1CO43896 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KIF1CO43896 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KIF1CO43896 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KIF1CO43896 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KIF1CO43896 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KIF1CO43896 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KIF1CO43896 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KIF1CO43896 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KIF1CO43896 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KIF1CO43896 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KIF1CO43896 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
KIF1CO43896 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
KIF1CO43896 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
KIF1CO43896 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KIF1CO43896 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KIF1CO43896 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KIF1CO43896 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KIF1CO43896 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KIF1CO43896 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KIF1CO43896 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KIF1CO43896 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KIF1CO43896 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KIF1CO43896 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KIF1CO43896 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KIF1CO43896 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KIF1CO43896 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KIF1CO43896 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KIF1CO43896 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KIF1CO43896 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KIF1CO43896 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KIF1CO43896 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KIF1CO43896 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KIF1CO43896 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KIF1CO43896 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KIF1CO43896 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KIF1CO43896 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KIF1CO43896 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KIF1CO43896 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KIF1CO43896 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIF1CO43896 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIF1CO43896 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIF1CO43896 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIF1CO43896 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIF1CO43896 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIF1CO43896 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIF1CO43896 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIF1CO43896 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIF1CO43896 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIF1CO43896 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIF1CO43896 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIF1CO43896 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIF1CO43896 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIF1CO43896 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIF1CO43896 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIF1CO43896 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIF1CO43896 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIF1CO43896 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIF1CO43896 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIF1CO43896 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIF1CO43896 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIF1CO43896 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIF1CO43896 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIF1CO43896 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIF1CO43896 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIF1CO43896 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF1CO43896 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF1CO43896 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF1CO43896 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF1CO43896 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF1CO43896 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF1CO43896 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF1CO43896 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF1CO43896 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF1CO43896 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIF1CO43896 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIF1CO43896 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIF1CO43896 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIF1CO43896 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIF1CO43896 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIF1CO43896 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIF1CO43896 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIF1CO43896 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIF1CO43896 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIF1CO43896 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIF1CO43896 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIF1CO43896 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KIF1CO43896 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KIF1CO43896 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KIF1CO43896 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms