Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CREB3O43889 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CREB3O43889 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CREB3O43889 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CREB3O43889 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CREB3O43889 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CREB3O43889 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CREB3O43889 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CREB3O43889 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CREB3O43889 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CREB3O43889 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CREB3O43889 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CREB3O43889 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CREB3O43889 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CREB3O43889 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CREB3O43889 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CREB3O43889 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CREB3O43889 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CREB3O43889 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CREB3O43889 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CREB3O43889 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CREB3O43889 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CREB3O43889 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CREB3O43889 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CREB3O43889 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CREB3O43889 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CREB3O43889 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CREB3O43889 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CREB3O43889 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CREB3O43889 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CREB3O43889 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CREB3O43889 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CREB3O43889 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CREB3O43889 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CREB3O43889 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CREB3O43889 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CREB3O43889 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CREB3O43889 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CREB3O43889 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CREB3O43889 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CREB3O43889 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CREB3O43889 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CREB3O43889 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CREB3O43889 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CREB3O43889 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CREB3O43889 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CREB3O43889 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CREB3O43889 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CREB3O43889 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CREB3O43889 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CREB3O43889 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CREB3O43889 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CREB3O43889 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CREB3O43889 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CREB3O43889 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CREB3O43889 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CREB3O43889 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CREB3O43889 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CREB3O43889 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CREB3O43889 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CREB3O43889 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CREB3O43889 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CREB3O43889 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CREB3O43889 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CREB3O43889 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CREB3O43889 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CREB3O43889 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CREB3O43889 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CREB3O43889 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CREB3O43889 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CREB3O43889 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CREB3O43889 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CREB3O43889 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CREB3O43889 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CREB3O43889 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CREB3O43889 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CREB3O43889 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CREB3O43889 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CREB3O43889 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CREB3O43889 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CREB3O43889 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CREB3O43889 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CREB3O43889 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CREB3O43889 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CREB3O43889 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CREB3O43889 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CREB3O43889 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CREB3O43889 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CREB3O43889 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CREB3O43889 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CREB3O43889 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CREB3O43889 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CREB3O43889 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CREB3O43889 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CREB3O43889 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CREB3O43889 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CREB3O43889 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CREB3O43889 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CREB3O43889 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CREB3O43889 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms