Protein–RNA interactions for Protein: J3QQQ9

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QQQ9 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
J3QQQ9 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
J3QQQ9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
J3QQQ9 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
J3QQQ9 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
J3QQQ9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
J3QQQ9 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
J3QQQ9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
J3QQQ9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
J3QQQ9 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
J3QQQ9 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
J3QQQ9 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
J3QQQ9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
J3QQQ9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
J3QQQ9 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
J3QQQ9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
J3QQQ9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
J3QQQ9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
J3QQQ9 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
J3QQQ9 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
J3QQQ9 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
J3QQQ9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
J3QQQ9 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
J3QQQ9 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
J3QQQ9 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
J3QQQ9 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
J3QQQ9 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
J3QQQ9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
J3QQQ9 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
J3QQQ9 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
J3QQQ9 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
J3QQQ9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
J3QQQ9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
J3QQQ9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
J3QQQ9 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
J3QQQ9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
J3QQQ9 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
J3QQQ9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
J3QQQ9 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
J3QQQ9 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
J3QQQ9 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
J3QQQ9 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
J3QQQ9 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
J3QQQ9 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
J3QQQ9 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
J3QQQ9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
J3QQQ9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
J3QQQ9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
J3QQQ9 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
J3QQQ9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
J3QQQ9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
J3QQQ9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
J3QQQ9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
J3QQQ9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
J3QQQ9 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
J3QQQ9 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
J3QQQ9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
J3QQQ9 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
J3QQQ9 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
J3QQQ9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
J3QQQ9 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
J3QQQ9 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
J3QQQ9 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
J3QQQ9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
J3QQQ9 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
J3QQQ9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
J3QQQ9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
J3QQQ9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
J3QQQ9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
J3QQQ9 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
J3QQQ9 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
J3QQQ9 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
J3QQQ9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
J3QQQ9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
J3QQQ9 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
J3QQQ9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
J3QQQ9 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
J3QQQ9 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
J3QQQ9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
J3QQQ9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
J3QQQ9 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
J3QQQ9 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
J3QQQ9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
J3QQQ9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
J3QQQ9 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
J3QQQ9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
J3QQQ9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
J3QQQ9 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
J3QQQ9 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
J3QQQ9 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
J3QQQ9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
J3QQQ9 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
J3QQQ9 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
J3QQQ9 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
J3QQQ9 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
J3QQQ9 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
J3QQQ9 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
J3QQQ9 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
J3QQQ9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
J3QQQ9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms