Protein–RNA interactions for Protein: I3L3M4

Claudin, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
I3L3M4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
I3L3M4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
I3L3M4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
I3L3M4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
I3L3M4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
I3L3M4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
I3L3M4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
I3L3M4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
I3L3M4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
I3L3M4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
I3L3M4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
I3L3M4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
I3L3M4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
I3L3M4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
I3L3M4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
I3L3M4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
I3L3M4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
I3L3M4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
I3L3M4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
I3L3M4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
I3L3M4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
I3L3M4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
I3L3M4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
I3L3M4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
I3L3M4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
I3L3M4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
I3L3M4 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
I3L3M4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
I3L3M4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
I3L3M4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
I3L3M4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
I3L3M4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
I3L3M4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
I3L3M4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
I3L3M4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
I3L3M4 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
I3L3M4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
I3L3M4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
I3L3M4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
I3L3M4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
I3L3M4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
I3L3M4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
I3L3M4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
I3L3M4 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
I3L3M4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
I3L3M4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
I3L3M4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
I3L3M4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
I3L3M4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
I3L3M4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
I3L3M4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
I3L3M4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
I3L3M4 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
I3L3M4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
I3L3M4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
I3L3M4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
I3L3M4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
I3L3M4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
I3L3M4 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
I3L3M4 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
I3L3M4 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
I3L3M4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
I3L3M4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
I3L3M4 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
I3L3M4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
I3L3M4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
I3L3M4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
I3L3M4 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
I3L3M4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
I3L3M4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
I3L3M4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
I3L3M4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
I3L3M4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
I3L3M4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
I3L3M4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
I3L3M4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
I3L3M4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
I3L3M4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
I3L3M4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
I3L3M4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
I3L3M4 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
I3L3M4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
I3L3M4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
I3L3M4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
I3L3M4 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
I3L3M4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
I3L3M4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
I3L3M4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
I3L3M4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
I3L3M4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
I3L3M4 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
I3L3M4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
I3L3M4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
I3L3M4 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
I3L3M4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
I3L3M4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
I3L3M4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
I3L3M4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
I3L3M4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
I3L3M4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms