Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ERVV-2B6SEH9 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ERVV-2B6SEH9 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ERVV-2B6SEH9 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ERVV-2B6SEH9 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ERVV-2B6SEH9 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ERVV-2B6SEH9 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ERVV-2B6SEH9 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ERVV-2B6SEH9 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
ERVV-2B6SEH9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ERVV-2B6SEH9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ERVV-2B6SEH9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ERVV-2B6SEH9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ERVV-2B6SEH9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ERVV-2B6SEH9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ERVV-2B6SEH9 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ERVV-2B6SEH9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ERVV-2B6SEH9 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ERVV-2B6SEH9 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
ERVV-2B6SEH9 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
ERVV-2B6SEH9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ERVV-2B6SEH9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ERVV-2B6SEH9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ERVV-2B6SEH9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ERVV-2B6SEH9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ERVV-2B6SEH9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ERVV-2B6SEH9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ERVV-2B6SEH9 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ERVV-2B6SEH9 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ERVV-2B6SEH9 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ERVV-2B6SEH9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ERVV-2B6SEH9 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ERVV-2B6SEH9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ERVV-2B6SEH9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ERVV-2B6SEH9 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ERVV-2B6SEH9 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ERVV-2B6SEH9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ERVV-2B6SEH9 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ERVV-2B6SEH9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ERVV-2B6SEH9 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ERVV-2B6SEH9 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ERVV-2B6SEH9 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ERVV-2B6SEH9 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ERVV-2B6SEH9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ERVV-2B6SEH9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ERVV-2B6SEH9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ERVV-2B6SEH9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ERVV-2B6SEH9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ERVV-2B6SEH9 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ERVV-2B6SEH9 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ERVV-2B6SEH9 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ERVV-2B6SEH9 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ERVV-2B6SEH9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ERVV-2B6SEH9 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ERVV-2B6SEH9 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ERVV-2B6SEH9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ERVV-2B6SEH9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ERVV-2B6SEH9 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ERVV-2B6SEH9 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ERVV-2B6SEH9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ERVV-2B6SEH9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ERVV-2B6SEH9 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ERVV-2B6SEH9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ERVV-2B6SEH9 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ERVV-2B6SEH9 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
ERVV-2B6SEH9 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ERVV-2B6SEH9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ERVV-2B6SEH9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ERVV-2B6SEH9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ERVV-2B6SEH9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ERVV-2B6SEH9 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ERVV-2B6SEH9 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ERVV-2B6SEH9 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ERVV-2B6SEH9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ERVV-2B6SEH9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ERVV-2B6SEH9 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ERVV-2B6SEH9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ERVV-2B6SEH9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
ERVV-2B6SEH9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ERVV-2B6SEH9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ERVV-2B6SEH9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ERVV-2B6SEH9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ERVV-2B6SEH9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ERVV-2B6SEH9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ERVV-2B6SEH9 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ERVV-2B6SEH9 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ERVV-2B6SEH9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ERVV-2B6SEH9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ERVV-2B6SEH9 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ERVV-2B6SEH9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ERVV-2B6SEH9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ERVV-2B6SEH9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
ERVV-2B6SEH9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ERVV-2B6SEH9 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ERVV-2B6SEH9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ERVV-2B6SEH9 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ERVV-2B6SEH9 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ERVV-2B6SEH9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ERVV-2B6SEH9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ERVV-2B6SEH9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms