Protein–RNA interactions for Protein: A4D0S4

LAMB4, Laminin subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB4A4D0S4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LAMB4A4D0S4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LAMB4A4D0S4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
LAMB4A4D0S4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LAMB4A4D0S4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LAMB4A4D0S4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LAMB4A4D0S4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LAMB4A4D0S4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
LAMB4A4D0S4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
LAMB4A4D0S4 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
LAMB4A4D0S4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LAMB4A4D0S4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LAMB4A4D0S4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LAMB4A4D0S4 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LAMB4A4D0S4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LAMB4A4D0S4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LAMB4A4D0S4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LAMB4A4D0S4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LAMB4A4D0S4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LAMB4A4D0S4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LAMB4A4D0S4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LAMB4A4D0S4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LAMB4A4D0S4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LAMB4A4D0S4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LAMB4A4D0S4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LAMB4A4D0S4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LAMB4A4D0S4 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LAMB4A4D0S4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LAMB4A4D0S4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LAMB4A4D0S4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
LAMB4A4D0S4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LAMB4A4D0S4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LAMB4A4D0S4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LAMB4A4D0S4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LAMB4A4D0S4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LAMB4A4D0S4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LAMB4A4D0S4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LAMB4A4D0S4 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LAMB4A4D0S4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LAMB4A4D0S4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LAMB4A4D0S4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LAMB4A4D0S4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LAMB4A4D0S4 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LAMB4A4D0S4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LAMB4A4D0S4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LAMB4A4D0S4 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
LAMB4A4D0S4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LAMB4A4D0S4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LAMB4A4D0S4 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LAMB4A4D0S4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LAMB4A4D0S4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LAMB4A4D0S4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LAMB4A4D0S4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LAMB4A4D0S4 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LAMB4A4D0S4 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LAMB4A4D0S4 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LAMB4A4D0S4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LAMB4A4D0S4 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LAMB4A4D0S4 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LAMB4A4D0S4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LAMB4A4D0S4 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LAMB4A4D0S4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LAMB4A4D0S4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LAMB4A4D0S4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LAMB4A4D0S4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LAMB4A4D0S4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LAMB4A4D0S4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LAMB4A4D0S4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LAMB4A4D0S4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LAMB4A4D0S4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LAMB4A4D0S4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LAMB4A4D0S4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LAMB4A4D0S4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LAMB4A4D0S4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LAMB4A4D0S4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LAMB4A4D0S4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LAMB4A4D0S4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
LAMB4A4D0S4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LAMB4A4D0S4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LAMB4A4D0S4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LAMB4A4D0S4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LAMB4A4D0S4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LAMB4A4D0S4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LAMB4A4D0S4 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LAMB4A4D0S4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LAMB4A4D0S4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LAMB4A4D0S4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LAMB4A4D0S4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LAMB4A4D0S4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LAMB4A4D0S4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LAMB4A4D0S4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LAMB4A4D0S4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LAMB4A4D0S4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LAMB4A4D0S4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LAMB4A4D0S4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LAMB4A4D0S4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LAMB4A4D0S4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LAMB4A4D0S4 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LAMB4A4D0S4 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LAMB4A4D0S4 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms