Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YXV3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YXV3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
A0A0J9YXV3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
A0A0J9YXV3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A0A0J9YXV3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
A0A0J9YXV3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
A0A0J9YXV3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
A0A0J9YXV3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
A0A0J9YXV3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
A0A0J9YXV3 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A0A0J9YXV3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
A0A0J9YXV3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A0A0J9YXV3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A0A0J9YXV3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A0A0J9YXV3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A0A0J9YXV3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
A0A0J9YXV3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
A0A0J9YXV3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
A0A0J9YXV3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
A0A0J9YXV3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
A0A0J9YXV3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A0A0J9YXV3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A0A0J9YXV3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
A0A0J9YXV3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A0A0J9YXV3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A0A0J9YXV3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
A0A0J9YXV3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
A0A0J9YXV3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
A0A0J9YXV3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A0A0J9YXV3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A0A0J9YXV3 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A0A0J9YXV3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A0A0J9YXV3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
A0A0J9YXV3 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A0A0J9YXV3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A0A0J9YXV3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A0J9YXV3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A0J9YXV3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A0J9YXV3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A0J9YXV3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A0J9YXV3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A0J9YXV3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A0J9YXV3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A0J9YXV3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A0J9YXV3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A0J9YXV3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A0J9YXV3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A0J9YXV3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A0J9YXV3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A0J9YXV3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A0J9YXV3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A0J9YXV3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A0J9YXV3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A0J9YXV3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A0J9YXV3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A0J9YXV3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A0J9YXV3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A0J9YXV3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A0J9YXV3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A0J9YXV3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A0J9YXV3 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A0J9YXV3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A0J9YXV3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A0J9YXV3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A0J9YXV3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A0J9YXV3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A0J9YXV3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A0J9YXV3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A0J9YXV3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A0J9YXV3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A0J9YXV3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A0J9YXV3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A0J9YXV3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A0J9YXV3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A0J9YXV3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A0J9YXV3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A0J9YXV3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A0J9YXV3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A0J9YXV3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A0J9YXV3 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A0J9YXV3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A0J9YXV3 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A0J9YXV3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A0J9YXV3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A0J9YXV3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A0J9YXV3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A0J9YXV3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A0J9YXV3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A0J9YXV3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A0J9YXV3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A0J9YXV3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A0J9YXV3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A0J9YXV3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A0J9YXV3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A0J9YXV3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A0J9YXV3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A0J9YXV3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A0J9YXV3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A0J9YXV3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A0J9YXV3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A0J9YXV3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms