Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6H5

TRBV20OR9-2, T-cell receptor beta variable 20/OR9-2 (non-functional) (Fragment), humanhuman

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Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17■□□□□ 0.31
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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TRBV20OR9-2A0A075B6H5 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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