Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUP7

TRMT13, tRNA:m(4)X modification enzyme TRM13 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT13Q9NUP7 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 KRT8P5-201ENST00000592443 1458 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 CPEB1-213ENST00000617462 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 THPO-203ENST00000445696 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 LINC00943-204ENST00000537374 1688 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 MIR100HG-219ENST00000533109 1794 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 ATP6V1B1-201ENST00000234396 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 SERPINI1-202ENST00000446050 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 TEX38-201ENST00000334122 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 RHCE-203ENST00000346452 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 C9orf24-202ENST00000379124 648 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 AL358876.2-201ENST00000424689 477 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 AL606970.2-201ENST00000434596 470 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 NR1I3-210ENST00000437437 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 LINC02151-201ENST00000452629 921 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 TCEA3-204ENST00000461794 713 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 VAMP2-203ENST00000481878 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 FAM213AP2-201ENST00000521579 683 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 RPL10P8-201ENST00000522888 313 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 FTH1-205ENST00000529631 507 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 IMMP1L-215ENST00000534812 612 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 AL157871.1-201ENST00000555428 429 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 TRPM1-210ENST00000559179 1002 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 AC025219.1-201ENST00000559299 526 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 MIR4539-201ENST00000579784 60 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 AL589743.3-201ENST00000604121 517 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 AC022001.3-201ENST00000606330 596 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 KCNQ1OT1_1.1-201ENST00000622358 464 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 TRAP1-201ENST00000246957 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 KIR2DL4-203ENST00000357494 1396 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 IMPDH1P5-201ENST00000439688 1540 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 RAP1A-201ENST00000356415 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 RMND5B-212ENST00000542098 1681 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 PRAMEF25-201ENST00000614839 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 PRAMEF26-201ENST00000624207 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 NUB1-212ENST00000568733 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 RABL2B-203ENST00000395591 1987 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 IGHV3-66-201ENST00000390632 427 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 CYCS-203ENST00000409764 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 HNRNPA1P33-201ENST00000421426 561 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 AC079325.1-201ENST00000430386 857 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 AC114781.1-201ENST00000450559 1028 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 RN7SL677P-201ENST00000466970 319 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 EFNA5-204ENST00000509503 637 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 AC090589.3-201ENST00000524412 574 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 SMCO4-202ENST00000525141 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 BBOX1-AS1-203ENST00000530430 879 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 BBOX1-AS1-204ENST00000531363 745 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 TEX38-204ENST00000564373 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 RPL26-209ENST00000584164 873 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 SEM1-201ENST00000248566 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 KIAA0391-211ENST00000605870 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 GMPR2-205ENST00000456667 1484 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 KATNAL1-202ENST00000380617 1634 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 ZP4-201ENST00000366570 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 DDX19B-208ENST00000563392 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 NDUFAF6-201ENST00000396111 1869 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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