Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AP003028.1-201ENST00000577699 1033 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 AP000894.2-203ENST00000580612 439 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 AC068987.3-201ENST00000637934 1195 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 C1QTNF9-202ENST00000382071 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 PRIM1-201ENST00000338193 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 TESPA1-202ENST00000449076 2010 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 MCEE-201ENST00000244217 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 HIST1H1C-201ENST00000343677 642 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 HIST1H4C-201ENST00000377803 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 CD72-203ENST00000378431 849 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 AC005102.1-201ENST00000403118 479 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 AL117329.2-201ENST00000413815 740 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 AC109779.1-202ENST00000439810 579 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 CHCHD3P3-201ENST00000446783 640 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 AC020656.1-201ENST00000548900 599 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 RN7SL784P-201ENST00000577319 342 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 AP002986.1-203ENST00000602310 330 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 Metazoa_SRP.186-201ENST00000617234 362 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 MGRN1-211ENST00000588994 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 SARS-201ENST00000234677 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 AL359915.2-202ENST00000440150 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
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PTPRMP28827 LINC01515-201ENST00000433152 1339 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 AC002550.1-201ENST00000565916 1379 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
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PTPRMP28827 CDC16-201ENST00000252457 2034 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 CDC16-205ENST00000375308 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 CREB5-203ENST00000396299 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 ACR-201ENST00000216139 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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PTPRMP28827 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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PTPRMP28827 LY6D-201ENST00000301263 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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PTPRMP28827 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 KRT31-201ENST00000251645 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 ZNF277-201ENST00000361822 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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PTPRMP28827 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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PTPRMP28827 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 FARS2-201ENST00000274680 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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PTPRMP28827 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 THPO-203ENST00000445696 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 CPA4-210ENST00000493259 1512 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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