Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 AL512324.3-201ENST00000619383 882 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 PPARG-206ENST00000397012 2006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 NOBOX-201ENST00000467773 2076 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 AC109326.1-201ENST00000624705 1321 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 SLC25A30-207ENST00000539591 3608 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 LINGO1-AS1-201ENST00000558691 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 ZNF114-201ENST00000315849 2206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 FPR2-203ENST00000598953 1544 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 RPL19P20-201ENST00000415648 591 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 AC098934.2-202ENST00000438944 1033 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 AC131235.2-201ENST00000445553 1057 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 CHIAP2-202ENST00000449687 669 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 AC079340.2-201ENST00000504957 495 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 NUP210P2-201ENST00000510577 282 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 AL157871.1-201ENST00000555428 429 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 AC093072.1-201ENST00000589196 602 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 CBR3-AS1-206ENST00000608632 659 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 AC087893.1-201ENST00000612818 664 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 PSME2-217ENST00000615264 874 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 PAX8-AS1-219ENST00000623306 840 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 GABARAPL1-219ENST00000629504 379 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 PSME2-218ENST00000630027 185 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 GUCY1B3-207ENST00000513437 2355 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 DEGS1-202ENST00000391877 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 ALOX15P2-201ENST00000340858 1897 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 ALLC-201ENST00000252505 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 CTCFL-211ENST00000502686 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 C12orf66-201ENST00000311915 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 CDC20P1-201ENST00000488829 1500 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 GIMAP4-202ENST00000461940 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 BX005132.1-201ENST00000641403 1580 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 IL18BP-202ENST00000337131 1606 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 OLFML1-204ENST00000530135 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 PECR-201ENST00000265322 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 PPM1K-201ENST00000295908 1940 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 JAML-202ENST00000356289 1944 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 SDR16C5-203ENST00000522671 1988 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 IZUMO1R-201ENST00000328458 798 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 TEX38-201ENST00000334122 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 LCE2D-201ENST00000368784 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 KIR2DL4-207ENST00000396293 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 KRT18P39-201ENST00000415349 1299 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 HLA-DQB3-203ENST00000425319 356 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 AC002451.1-202ENST00000432265 771 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 AL133351.2-201ENST00000437718 484 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 Z84721.1-201ENST00000438841 372 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 CHTF8-207ENST00000520529 475 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 SCGB1A1-202ENST00000534397 466 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 RERG-204ENST00000536465 2134 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 MED11-203ENST00000575284 652 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 Z93930.2-203ENST00000585003 516 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 BOLA3P2-201ENST00000586496 323 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 NRSN2-205ENST00000608467 504 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 ZNF268-219ENST00000611984 583 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 MIR6125-201ENST00000618986 96 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
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