Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 COMMD10-207ENST00000632434 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 IGF2BP2-203ENST00000421047 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 PIGG-205ENST00000503111 2629 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 ERGIC3-202ENST00000348547 1359 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 CYP20A1-210ENST00000613925 1986 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 ZNF555-203ENST00000591539 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 YWHAQ-202ENST00000381844 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 NNMT-201ENST00000299964 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 DHRS12-202ENST00000280056 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 LSM2-208ENST00000375661 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 HNRNPA1P19-201ENST00000405292 370 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 SLC2A11-208ENST00000405847 730 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 LINC00189-201ENST00000420364 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 AL161644.1-201ENST00000426901 1111 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 AC053503.4-201ENST00000431827 224 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 AC046143.1-201ENST00000447139 972 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 TMEM91-206ENST00000447302 721 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 AC113340.1-201ENST00000475257 636 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 AC108082.1-201ENST00000510857 331 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 AL645949.2-201ENST00000513434 786 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 AC105424.1-201ENST00000514583 209 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 AC002519.2-201ENST00000563575 539 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 ARPP19-206ENST00000564163 718 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 GABARAPL2-203ENST00000565057 571 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 PLXNA4-203ENST00000378539 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 RORC-201ENST00000318247 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 CCDC149-208ENST00000635206 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 AC026271.4-201ENST00000578214 1833 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 AL807752.1-201ENST00000395082 1322 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 TMEM192-203ENST00000506087 2225 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 SNAPC5-203ENST00000395589 749 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 SNAP25-AS1-202ENST00000426491 804 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 AC010163.1-201ENST00000434440 520 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 RAET1G-203ENST00000479265 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 SNAPC5-205ENST00000563480 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 AP006621.5-202ENST00000623692 636 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 BIN3-212ENST00000640731 450 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 SERPINA1-205ENST00000404814 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 ANXA13-201ENST00000262219 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 LILRA2-204ENST00000391738 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 ENO3-201ENST00000323997 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 RETREG3-203ENST00000585894 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 SP140L-203ENST00000415673 2665 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 PRKAG1-201ENST00000316299 1683 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 MIR193A-201ENST00000384882 88 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 OAZ3-202ENST00000400999 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 MBL3P-201ENST00000402234 644 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 AL365194.1-201ENST00000440032 361 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 AC105446.1-201ENST00000441882 407 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 GTF2I-203ENST00000443166 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 AC067942.2-201ENST00000506227 1268 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 AC022447.2-201ENST00000509750 543 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 AC106789.1-201ENST00000512927 570 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 PDCD2-205ENST00000537445 1114 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 ZFYVE1-206ENST00000555072 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 AL160313.2-201ENST00000555875 493 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms