Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 SARNP-201ENST00000336133 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 RNA5SP358-201ENST00000362973 117 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 CFAP58-201ENST00000369703 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 EXOSC1-204ENST00000370902 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 GAGE12H-201ENST00000381722 527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 MIR197-201ENST00000384976 75 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 AC004231.1-201ENST00000418393 815 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 UQCRFS1P2-201ENST00000426701 722 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 ALG1L10P-201ENST00000437882 424 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 LINC01697-204ENST00000458316 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 HOXA-AS2-205ENST00000518088 509 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 AP003469.2-201ENST00000524369 430 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 HNRNPA1P62-201ENST00000559372 952 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 CLEC4M-210ENST00000597522 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 KXD1-210ENST00000599000 498 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 CBR3-AS1-205ENST00000608622 586 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 C10orf128-203ENST00000374153 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 AC092809.4-201ENST00000420350 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 MED8-201ENST00000290663 1483 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 TTC26-207ENST00000478836 1794 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 ARSG-209ENST00000621439 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 NUDT7-201ENST00000268533 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 RPL36AL-201ENST00000298289 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 C10orf99-201ENST00000372126 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 CST13P-203ENST00000413633 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 AL031727.2-201ENST00000416470 207 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 AL392185.1-201ENST00000419620 395 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 LINC00969-204ENST00000420851 868 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 OR7E37P-201ENST00000421076 897 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 RRM2P2-201ENST00000436212 652 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 OSER1-AS1-202ENST00000437730 1563 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 FAM86DP-202ENST00000477247 995 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 RN7SL265P-201ENST00000486808 300 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 AC016924.1-201ENST00000511512 501 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 AL645949.2-201ENST00000513434 786 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 AC022239.3-201ENST00000528629 544 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 NUDT7-205ENST00000564085 899 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 AC005726.6-201ENST00000579019 1083 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 RN7SL217P-201ENST00000584520 286 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 AC090376.1-202ENST00000587276 470 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 SIGLEC17P-201ENST00000593736 484 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 AC011491.3-201ENST00000595644 559 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 AC090826.3-201ENST00000611178 834 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 NUDT7-207ENST00000613075 1073 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 TMPRSS4-213ENST00000522824 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 ZNF493-208ENST00000599461 1769 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 SCHIP1-201ENST00000445224 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 LIPG-205ENST00000580036 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 OR8J1-202ENST00000533152 1320 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 HAND2-204ENST00000621866 1337 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 KRT17P4-205ENST00000579946 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 ADD1-207ENST00000446856 3745 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 TESPA1-201ENST00000316577 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 SERPINB8-209ENST00000636430 1719 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 LINC01551-201ENST00000399387 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 HCK-208ENST00000534862 1581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 HCK-211ENST00000639405 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 ITGB1BP1-201ENST00000238091 1772 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 AMHR2-204ENST00000550311 1787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 SMUG1-201ENST00000243112 627 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 RPL23-203ENST00000394332 625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 IFT22-204ENST00000437644 875 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 RPS19P7-201ENST00000455650 396 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 RN7SL674P-201ENST00000463397 275 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 RN7SL164P-201ENST00000482613 303 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 C21orf62-203ENST00000487113 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 PRDM2-214ENST00000505823 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 GFRA2-203ENST00000517892 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 TRIAP1-202ENST00000546954 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 AC013489.2-201ENST00000558732 276 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 RPL23-207ENST00000577407 615 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
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