Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 MPPE1-204ENST00000344987 1831 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC27P30260 AIFM1P1-201ENST00000413342 1841 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC27P30260 C1QTNF6-201ENST00000337843 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC27P30260 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC27P30260 GRIA3-208ENST00000620581 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC27P30260 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC27P30260 KRT8P25-201ENST00000473150 1456 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC27P30260 AC138150.2-201ENST00000589796 2053 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC27P30260 GNB5-203ENST00000396335 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC27P30260 PRAM1-201ENST00000423345 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC27P30260 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC27P30260 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC27P30260 MRFAP1L1-201ENST00000320848 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC27P30260 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC27P30260 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC27P30260 AC018445.4-201ENST00000624066 2291 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC27P30260 PPARGC1B-202ENST00000360453 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC27P30260 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC27P30260 HAO1-201ENST00000378789 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC27P30260 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC27P30260 PECR-201ENST00000265322 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC27P30260 ZSCAN21-203ENST00000456748 1904 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC27P30260 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC27P30260 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC27P30260 TTN-AS1-209ENST00000456053 2033 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC27P30260 ANKRA2-201ENST00000296785 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC27P30260 ENOX1-201ENST00000261488 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC27P30260 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC27P30260 OLFML2B-202ENST00000367938 1153 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC27P30260 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC27P30260 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC27P30260 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC27P30260 MRPS12-202ENST00000402029 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC27P30260 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC27P30260 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC27P30260 AC092903.1-201ENST00000466506 262 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC27P30260 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC27P30260 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC27P30260 AP000920.1-201ENST00000531824 344 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC27P30260 AL139316.1-201ENST00000555643 568 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC27P30260 AC026583.1-201ENST00000561310 569 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC27P30260 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC27P30260 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC27P30260 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC27P30260 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC27P30260 AL590094.1-208ENST00000636917 627 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC27P30260 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC27P30260 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC27P30260 BCL2L1-202ENST00000376055 2383 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC27P30260 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC27P30260 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC27P30260 RGS6-202ENST00000355512 1564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC27P30260 DDX11L1-202ENST00000456328 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC27P30260 DDX11L10-202ENST00000513886 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC27P30260 DDX11L9-203ENST00000562189 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC27P30260 MATN1-AS1-201ENST00000414532 3925 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC27P30260 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC27P30260 NR1H4-203ENST00000392986 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC27P30260 EIF3CL-201ENST00000380876 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC27P30260 SULT2A1-201ENST00000222002 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC27P30260 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC27P30260 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC27P30260 DHRS7B-202ENST00000395511 2175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC27P30260 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC27P30260 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC27P30260 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC27P30260 STK24-201ENST00000376547 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC27P30260 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC27P30260 FAM214B-205ENST00000488109 2999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC27P30260 SEZ6L-201ENST00000248933 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC27P30260 C9orf170-201ENST00000623052 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC27P30260 SEZ6L-210ENST00000629590 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC27P30260 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC27P30260 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC27P30260 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC27P30260 TPI1P3-201ENST00000335020 740 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC27P30260 HIST1H2BK-201ENST00000356950 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC27P30260 DPPA5-201ENST00000370370 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC27P30260 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC27P30260 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC27P30260 LINC00484-201ENST00000414768 561 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC27P30260 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC27P30260 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC27P30260 AL355482.2-201ENST00000428646 1145 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC27P30260 MED19-202ENST00000431606 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC27P30260 CU639417.1-201ENST00000464664 460 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC27P30260 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC27P30260 TBC1D3P6-201ENST00000505954 962 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC27P30260 AL161668.2-201ENST00000531638 492 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC27P30260 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC27P30260 AC026470.4-201ENST00000565812 308 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC27P30260 AP003071.1-201ENST00000567925 622 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC27P30260 FAM187B2P-201ENST00000577135 713 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC27P30260 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC27P30260 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC27P30260 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC27P30260 METTL23-211ENST00000589977 617 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC27P30260 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC27P30260 AC002985.1-201ENST00000596918 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC27P30260 H2BFS-201ENST00000599962 460 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms