Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 ADSSL1-208ENST00000555674 520 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 SYMPK-201ENST00000245934 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 TUBGCP5-208ENST00000620435 3342 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 MAGED4-201ENST00000375626 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 AL359915.2-202ENST00000440150 2469 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 ZNF41-202ENST00000377065 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 SLC38A7-201ENST00000219320 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 UBTF-209ENST00000529383 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 GZF1-202ENST00000377051 4740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 CUL2-210ENST00000626172 4115 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 KCNIP3-201ENST00000295225 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 SLC38A5-210ENST00000595796 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 DLG2-205ENST00000398301 2070 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 RBM22P2-201ENST00000393978 1814 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 ITFG1-204ENST00000544001 1849 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 TARS2-205ENST00000438568 2188 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 MAP2K4P1-202ENST00000602584 2539 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 PUM2-203ENST00000361078 6251 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 KIAA1958-202ENST00000374244 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 PLD5-204ENST00000442594 3305 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 CHD4-211ENST00000544484 6554 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 RAB37-205ENST00000392614 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 ZEB2-234ENST00000636413 8984 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 RMND5B-212ENST00000542098 1681 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 SMTN-203ENST00000358743 3198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 AL031687.1-201ENST00000450586 2137 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 APPBP2-201ENST00000083182 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 PNPLA6-204ENST00000545201 4502 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 LINC01002-209ENST00000631858 1761 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 DSP-202ENST00000418664 7812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 KLC2-206ENST00000417856 3015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 KCNH1-205ENST00000638498 3479 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 MINDY1-205ENST00000493834 1546 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 PI4KB-201ENST00000368872 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 ETAA1-201ENST00000272342 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 IWS1-201ENST00000295321 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 COPS7B-201ENST00000350033 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 RAP1GAP2-201ENST00000254695 6661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 PPT1-204ENST00000439754 2195 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 NBPF12-208ENST00000617931 7061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 SLC25A24-203ENST00000565488 4271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 TSC22D1-203ENST00000458659 4820 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 LAMTOR5-AS1-209ENST00000597455 805 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.5 ms