Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 60 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 FAM213A-204ENST00000372188 829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 LINC02369-202ENST00000540745 801 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 CTRC-201ENST00000375943 3147 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 RBM8A-204ENST00000583313 4961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 CTAGE7P-201ENST00000435712 2436 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 AL606760.3-201ENST00000569869 3591 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 YLPM1-201ENST00000325680 7108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 RPL13-201ENST00000311528 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 BAHCC1-206ENST00000584436 10801 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 AC008132.1-203ENST00000412938 5920 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 PLK4-210ENST00000514379 3060 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 STX16-205ENST00000361830 4318 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 IL17REL-201ENST00000341280 3500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 ACOXL-202ENST00000389811 2714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 WASL-201ENST00000223023 4435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 ANKRD34A-201ENST00000606888 3613 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 RGPD8-203ENST00000409750 5544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 C21orf62-AS1-201ENST00000382375 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 AC135012.1-201ENST00000563931 7430 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 GCC2-201ENST00000309863 7537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 NTM-206ENST00000427481 2583 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 TMEM182-202ENST00000409528 3112 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 DPAGT1-201ENST00000354202 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 ATG16L1-202ENST00000373525 2767 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 TRNAU1AP-201ENST00000373830 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 METTL13-201ENST00000361735 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 TMPRSS7-201ENST00000419127 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 KCNH1-201ENST00000271751 8172 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 NUTM2B-202ENST00000372321 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 HADHB-209ENST00000545822 1870 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 C9orf3-201ENST00000277198 1966 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 TRIM32-203ENST00000450136 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 FN1-202ENST00000336916 8435 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 ARHGEF4-212ENST00000525839 3828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 CHIC1-202ENST00000373504 6797 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 MAN2C1-201ENST00000267978 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 ANKRD34B-201ENST00000338682 3938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 KLK2-202ENST00000358049 2847 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 RAB43-204ENST00000393307 4203 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 USP36-202ENST00000449938 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 CRHR1-206ENST00000398285 2399 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 DAXX-203ENST00000414083 2355 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 GRID1-201ENST00000327946 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 AC011511.5-201ENST00000589379 3219 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 UBTF-209ENST00000529383 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 FAM131B-202ENST00000409346 4295 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 FAM86C1-202ENST00000359244 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 C3orf35-206ENST00000452017 513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 CEACAM20-206ENST00000621342 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 ADCY1-201ENST00000297323 12503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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