Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

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Length 561 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 PPP1R8-203ENST00000373931 2651 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 RASA4CP-203ENST00000446874 3193 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 ALKBH1-201ENST00000216489 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 TTC39B-201ENST00000297615 3053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 DHX16-201ENST00000376437 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 TRPC7-202ENST00000378459 2406 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 DHX30-201ENST00000348968 3994 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 RIN2-202ENST00000440354 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 PXK-210ENST00000479241 2817 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 LINC02369-202ENST00000540745 801 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 LAMTOR5-AS1-209ENST00000597455 805 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 TXNDC17-201ENST00000250101 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 ERCC4-207ENST00000575156 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 ADGRA1-201ENST00000392606 3438 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 PDE9A-202ENST00000328862 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 C2-209ENST00000452323 1999 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 MMD2-203ENST00000406755 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 LMO3-212ENST00000535535 1488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 ATG5-202ENST00000360666 2712 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 KIF9-208ENST00000452770 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 SCNN1B-202ENST00000343070 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 PPP2R2C-204ENST00000506140 1780 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 SLC35B3-201ENST00000379660 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 TUBB8P7-202ENST00000564451 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 HOXB-AS3-209ENST00000477144 743 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 AL365223.1-201ENST00000574864 1297 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 KLC2-206ENST00000417856 3015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 NCS1-201ENST00000372398 4991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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