Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
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ARL2-SNX15V9GYD0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
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ARL2-SNX15V9GYD0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
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