Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00312Q9Y6C7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00312Q9Y6C7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00312Q9Y6C7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00312Q9Y6C7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00312Q9Y6C7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00312Q9Y6C7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00312Q9Y6C7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00312Q9Y6C7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00312Q9Y6C7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00312Q9Y6C7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00312Q9Y6C7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LINC00312Q9Y6C7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LINC00312Q9Y6C7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00312Q9Y6C7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00312Q9Y6C7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00312Q9Y6C7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00312Q9Y6C7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00312Q9Y6C7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00312Q9Y6C7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00312Q9Y6C7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00312Q9Y6C7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00312Q9Y6C7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00312Q9Y6C7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00312Q9Y6C7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00312Q9Y6C7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00312Q9Y6C7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00312Q9Y6C7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00312Q9Y6C7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00312Q9Y6C7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00312Q9Y6C7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00312Q9Y6C7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00312Q9Y6C7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00312Q9Y6C7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00312Q9Y6C7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00312Q9Y6C7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00312Q9Y6C7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00312Q9Y6C7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00312Q9Y6C7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00312Q9Y6C7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00312Q9Y6C7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00312Q9Y6C7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00312Q9Y6C7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00312Q9Y6C7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00312Q9Y6C7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00312Q9Y6C7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00312Q9Y6C7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00312Q9Y6C7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00312Q9Y6C7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00312Q9Y6C7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00312Q9Y6C7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00312Q9Y6C7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00312Q9Y6C7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00312Q9Y6C7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00312Q9Y6C7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00312Q9Y6C7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00312Q9Y6C7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00312Q9Y6C7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00312Q9Y6C7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00312Q9Y6C7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00312Q9Y6C7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00312Q9Y6C7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00312Q9Y6C7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00312Q9Y6C7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00312Q9Y6C7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00312Q9Y6C7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00312Q9Y6C7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00312Q9Y6C7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00312Q9Y6C7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00312Q9Y6C7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00312Q9Y6C7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00312Q9Y6C7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00312Q9Y6C7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00312Q9Y6C7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00312Q9Y6C7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00312Q9Y6C7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00312Q9Y6C7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00312Q9Y6C7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00312Q9Y6C7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00312Q9Y6C7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00312Q9Y6C7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00312Q9Y6C7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00312Q9Y6C7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00312Q9Y6C7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00312Q9Y6C7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00312Q9Y6C7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00312Q9Y6C7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00312Q9Y6C7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00312Q9Y6C7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00312Q9Y6C7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00312Q9Y6C7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00312Q9Y6C7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00312Q9Y6C7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00312Q9Y6C7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00312Q9Y6C7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00312Q9Y6C7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00312Q9Y6C7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00312Q9Y6C7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00312Q9Y6C7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00312Q9Y6C7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms