Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X0

SNX10, Sorting nexin-10, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX10Q9Y5X0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX10Q9Y5X0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX10Q9Y5X0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX10Q9Y5X0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX10Q9Y5X0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX10Q9Y5X0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX10Q9Y5X0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX10Q9Y5X0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX10Q9Y5X0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX10Q9Y5X0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX10Q9Y5X0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX10Q9Y5X0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX10Q9Y5X0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX10Q9Y5X0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX10Q9Y5X0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX10Q9Y5X0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX10Q9Y5X0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX10Q9Y5X0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX10Q9Y5X0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX10Q9Y5X0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX10Q9Y5X0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX10Q9Y5X0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX10Q9Y5X0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX10Q9Y5X0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNX10Q9Y5X0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SNX10Q9Y5X0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SNX10Q9Y5X0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNX10Q9Y5X0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SNX10Q9Y5X0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SNX10Q9Y5X0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SNX10Q9Y5X0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNX10Q9Y5X0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SNX10Q9Y5X0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX10Q9Y5X0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX10Q9Y5X0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX10Q9Y5X0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX10Q9Y5X0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX10Q9Y5X0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX10Q9Y5X0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX10Q9Y5X0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX10Q9Y5X0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX10Q9Y5X0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX10Q9Y5X0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX10Q9Y5X0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX10Q9Y5X0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX10Q9Y5X0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX10Q9Y5X0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX10Q9Y5X0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX10Q9Y5X0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX10Q9Y5X0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX10Q9Y5X0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX10Q9Y5X0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX10Q9Y5X0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX10Q9Y5X0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX10Q9Y5X0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX10Q9Y5X0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX10Q9Y5X0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX10Q9Y5X0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX10Q9Y5X0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX10Q9Y5X0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX10Q9Y5X0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX10Q9Y5X0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX10Q9Y5X0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX10Q9Y5X0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX10Q9Y5X0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX10Q9Y5X0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX10Q9Y5X0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX10Q9Y5X0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX10Q9Y5X0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX10Q9Y5X0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX10Q9Y5X0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX10Q9Y5X0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX10Q9Y5X0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX10Q9Y5X0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX10Q9Y5X0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX10Q9Y5X0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX10Q9Y5X0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX10Q9Y5X0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX10Q9Y5X0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX10Q9Y5X0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX10Q9Y5X0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX10Q9Y5X0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX10Q9Y5X0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX10Q9Y5X0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX10Q9Y5X0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX10Q9Y5X0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX10Q9Y5X0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX10Q9Y5X0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX10Q9Y5X0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX10Q9Y5X0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX10Q9Y5X0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX10Q9Y5X0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX10Q9Y5X0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX10Q9Y5X0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX10Q9Y5X0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX10Q9Y5X0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX10Q9Y5X0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX10Q9Y5X0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX10Q9Y5X0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX10Q9Y5X0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms