Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5S2

CDC42BPB, Serine/threonine-protein kinase MRCK beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42BPBQ9Y5S2 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CDC42BPBQ9Y5S2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CDC42BPBQ9Y5S2 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CDC42BPBQ9Y5S2 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CDC42BPBQ9Y5S2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CDC42BPBQ9Y5S2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CDC42BPBQ9Y5S2 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CDC42BPBQ9Y5S2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CDC42BPBQ9Y5S2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CDC42BPBQ9Y5S2 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CDC42BPBQ9Y5S2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CDC42BPBQ9Y5S2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CDC42BPBQ9Y5S2 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CDC42BPBQ9Y5S2 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CDC42BPBQ9Y5S2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
CDC42BPBQ9Y5S2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CDC42BPBQ9Y5S2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CDC42BPBQ9Y5S2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CDC42BPBQ9Y5S2 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CDC42BPBQ9Y5S2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CDC42BPBQ9Y5S2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CDC42BPBQ9Y5S2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CDC42BPBQ9Y5S2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CDC42BPBQ9Y5S2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CDC42BPBQ9Y5S2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CDC42BPBQ9Y5S2 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CDC42BPBQ9Y5S2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CDC42BPBQ9Y5S2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CDC42BPBQ9Y5S2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CDC42BPBQ9Y5S2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CDC42BPBQ9Y5S2 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CDC42BPBQ9Y5S2 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CDC42BPBQ9Y5S2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CDC42BPBQ9Y5S2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CDC42BPBQ9Y5S2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
CDC42BPBQ9Y5S2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CDC42BPBQ9Y5S2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CDC42BPBQ9Y5S2 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
CDC42BPBQ9Y5S2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
CDC42BPBQ9Y5S2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CDC42BPBQ9Y5S2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CDC42BPBQ9Y5S2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CDC42BPBQ9Y5S2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CDC42BPBQ9Y5S2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CDC42BPBQ9Y5S2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CDC42BPBQ9Y5S2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
CDC42BPBQ9Y5S2 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
CDC42BPBQ9Y5S2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CDC42BPBQ9Y5S2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CDC42BPBQ9Y5S2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CDC42BPBQ9Y5S2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CDC42BPBQ9Y5S2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CDC42BPBQ9Y5S2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CDC42BPBQ9Y5S2 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CDC42BPBQ9Y5S2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CDC42BPBQ9Y5S2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CDC42BPBQ9Y5S2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CDC42BPBQ9Y5S2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CDC42BPBQ9Y5S2 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
CDC42BPBQ9Y5S2 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
CDC42BPBQ9Y5S2 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CDC42BPBQ9Y5S2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CDC42BPBQ9Y5S2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CDC42BPBQ9Y5S2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CDC42BPBQ9Y5S2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CDC42BPBQ9Y5S2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CDC42BPBQ9Y5S2 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CDC42BPBQ9Y5S2 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CDC42BPBQ9Y5S2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CDC42BPBQ9Y5S2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CDC42BPBQ9Y5S2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CDC42BPBQ9Y5S2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CDC42BPBQ9Y5S2 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CDC42BPBQ9Y5S2 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CDC42BPBQ9Y5S2 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CDC42BPBQ9Y5S2 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CDC42BPBQ9Y5S2 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CDC42BPBQ9Y5S2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
CDC42BPBQ9Y5S2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
CDC42BPBQ9Y5S2 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
CDC42BPBQ9Y5S2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
CDC42BPBQ9Y5S2 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.05
CDC42BPBQ9Y5S2 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.05
CDC42BPBQ9Y5S2 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
CDC42BPBQ9Y5S2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CDC42BPBQ9Y5S2 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
CDC42BPBQ9Y5S2 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CDC42BPBQ9Y5S2 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CDC42BPBQ9Y5S2 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CDC42BPBQ9Y5S2 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CDC42BPBQ9Y5S2 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CDC42BPBQ9Y5S2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CDC42BPBQ9Y5S2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CDC42BPBQ9Y5S2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CDC42BPBQ9Y5S2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CDC42BPBQ9Y5S2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CDC42BPBQ9Y5S2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CDC42BPBQ9Y5S2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CDC42BPBQ9Y5S2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CDC42BPBQ9Y5S2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms