Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5K6

CD2AP, CD2-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD2APQ9Y5K6 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CD2APQ9Y5K6 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CD2APQ9Y5K6 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CD2APQ9Y5K6 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CD2APQ9Y5K6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CD2APQ9Y5K6 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CD2APQ9Y5K6 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CD2APQ9Y5K6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CD2APQ9Y5K6 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CD2APQ9Y5K6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CD2APQ9Y5K6 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CD2APQ9Y5K6 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CD2APQ9Y5K6 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CD2APQ9Y5K6 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CD2APQ9Y5K6 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CD2APQ9Y5K6 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CD2APQ9Y5K6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CD2APQ9Y5K6 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CD2APQ9Y5K6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CD2APQ9Y5K6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CD2APQ9Y5K6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CD2APQ9Y5K6 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CD2APQ9Y5K6 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CD2APQ9Y5K6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CD2APQ9Y5K6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CD2APQ9Y5K6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CD2APQ9Y5K6 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CD2APQ9Y5K6 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CD2APQ9Y5K6 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CD2APQ9Y5K6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CD2APQ9Y5K6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CD2APQ9Y5K6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CD2APQ9Y5K6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CD2APQ9Y5K6 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CD2APQ9Y5K6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CD2APQ9Y5K6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CD2APQ9Y5K6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CD2APQ9Y5K6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CD2APQ9Y5K6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CD2APQ9Y5K6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CD2APQ9Y5K6 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CD2APQ9Y5K6 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CD2APQ9Y5K6 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CD2APQ9Y5K6 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CD2APQ9Y5K6 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CD2APQ9Y5K6 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CD2APQ9Y5K6 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CD2APQ9Y5K6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CD2APQ9Y5K6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CD2APQ9Y5K6 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CD2APQ9Y5K6 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CD2APQ9Y5K6 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CD2APQ9Y5K6 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CD2APQ9Y5K6 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CD2APQ9Y5K6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CD2APQ9Y5K6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CD2APQ9Y5K6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CD2APQ9Y5K6 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CD2APQ9Y5K6 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CD2APQ9Y5K6 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CD2APQ9Y5K6 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CD2APQ9Y5K6 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CD2APQ9Y5K6 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CD2APQ9Y5K6 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CD2APQ9Y5K6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
CD2APQ9Y5K6 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
CD2APQ9Y5K6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CD2APQ9Y5K6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CD2APQ9Y5K6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CD2APQ9Y5K6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CD2APQ9Y5K6 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CD2APQ9Y5K6 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CD2APQ9Y5K6 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CD2APQ9Y5K6 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CD2APQ9Y5K6 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CD2APQ9Y5K6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CD2APQ9Y5K6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CD2APQ9Y5K6 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CD2APQ9Y5K6 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CD2APQ9Y5K6 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CD2APQ9Y5K6 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CD2APQ9Y5K6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CD2APQ9Y5K6 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CD2APQ9Y5K6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CD2APQ9Y5K6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CD2APQ9Y5K6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CD2APQ9Y5K6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CD2APQ9Y5K6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CD2APQ9Y5K6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CD2APQ9Y5K6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CD2APQ9Y5K6 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CD2APQ9Y5K6 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CD2APQ9Y5K6 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CD2APQ9Y5K6 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CD2APQ9Y5K6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CD2APQ9Y5K6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CD2APQ9Y5K6 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CD2APQ9Y5K6 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CD2APQ9Y5K6 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CD2APQ9Y5K6 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms