Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Q9Y3F1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Q9Y3F1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Q9Y3F1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Q9Y3F1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Q9Y3F1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Q9Y3F1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Q9Y3F1 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Q9Y3F1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Q9Y3F1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Q9Y3F1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Q9Y3F1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Q9Y3F1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Q9Y3F1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Q9Y3F1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Q9Y3F1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Q9Y3F1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Q9Y3F1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Q9Y3F1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Q9Y3F1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Q9Y3F1 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Q9Y3F1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Q9Y3F1 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Q9Y3F1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Q9Y3F1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Q9Y3F1 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Q9Y3F1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Q9Y3F1 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Q9Y3F1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Q9Y3F1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Q9Y3F1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Q9Y3F1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Q9Y3F1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Q9Y3F1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Q9Y3F1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Q9Y3F1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Q9Y3F1 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Q9Y3F1 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Q9Y3F1 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Q9Y3F1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Q9Y3F1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Q9Y3F1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Q9Y3F1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Q9Y3F1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Q9Y3F1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Q9Y3F1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Q9Y3F1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Q9Y3F1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Q9Y3F1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Q9Y3F1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Q9Y3F1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Q9Y3F1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Q9Y3F1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Q9Y3F1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Q9Y3F1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Q9Y3F1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Q9Y3F1 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Q9Y3F1 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Q9Y3F1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Q9Y3F1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Q9Y3F1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Q9Y3F1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Q9Y3F1 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Q9Y3F1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Q9Y3F1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Q9Y3F1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Q9Y3F1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Q9Y3F1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Q9Y3F1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Q9Y3F1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Q9Y3F1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Q9Y3F1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Q9Y3F1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Q9Y3F1 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Q9Y3F1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Q9Y3F1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Q9Y3F1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Q9Y3F1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Q9Y3F1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Q9Y3F1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Q9Y3F1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Q9Y3F1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Q9Y3F1 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Q9Y3F1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Q9Y3F1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Q9Y3F1 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Q9Y3F1 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Q9Y3F1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Q9Y3F1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Q9Y3F1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Q9Y3F1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Q9Y3F1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Q9Y3F1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Q9Y3F1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Q9Y3F1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Q9Y3F1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Q9Y3F1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Q9Y3F1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Q9Y3F1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Q9Y3F1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms