Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC4Q9Y296 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC4Q9Y296 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC4Q9Y296 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC4Q9Y296 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC4Q9Y296 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC4Q9Y296 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC4Q9Y296 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC4Q9Y296 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC4Q9Y296 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC4Q9Y296 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC4Q9Y296 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC4Q9Y296 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC4Q9Y296 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC4Q9Y296 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC4Q9Y296 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC4Q9Y296 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC4Q9Y296 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC4Q9Y296 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC4Q9Y296 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC4Q9Y296 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC4Q9Y296 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC4Q9Y296 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC4Q9Y296 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC4Q9Y296 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAPPC4Q9Y296 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAPPC4Q9Y296 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAPPC4Q9Y296 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAPPC4Q9Y296 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAPPC4Q9Y296 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAPPC4Q9Y296 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAPPC4Q9Y296 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAPPC4Q9Y296 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAPPC4Q9Y296 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAPPC4Q9Y296 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
TRAPPC4Q9Y296 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRAPPC4Q9Y296 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRAPPC4Q9Y296 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC4Q9Y296 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC4Q9Y296 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC4Q9Y296 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC4Q9Y296 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC4Q9Y296 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC4Q9Y296 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC4Q9Y296 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC4Q9Y296 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC4Q9Y296 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAPPC4Q9Y296 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAPPC4Q9Y296 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAPPC4Q9Y296 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAPPC4Q9Y296 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAPPC4Q9Y296 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAPPC4Q9Y296 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAPPC4Q9Y296 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAPPC4Q9Y296 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAPPC4Q9Y296 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAPPC4Q9Y296 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAPPC4Q9Y296 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAPPC4Q9Y296 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAPPC4Q9Y296 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAPPC4Q9Y296 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAPPC4Q9Y296 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAPPC4Q9Y296 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAPPC4Q9Y296 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAPPC4Q9Y296 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAPPC4Q9Y296 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAPPC4Q9Y296 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAPPC4Q9Y296 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAPPC4Q9Y296 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAPPC4Q9Y296 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAPPC4Q9Y296 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAPPC4Q9Y296 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAPPC4Q9Y296 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAPPC4Q9Y296 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAPPC4Q9Y296 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAPPC4Q9Y296 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAPPC4Q9Y296 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAPPC4Q9Y296 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAPPC4Q9Y296 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAPPC4Q9Y296 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAPPC4Q9Y296 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAPPC4Q9Y296 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAPPC4Q9Y296 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAPPC4Q9Y296 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC4Q9Y296 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC4Q9Y296 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC4Q9Y296 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC4Q9Y296 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC4Q9Y296 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC4Q9Y296 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC4Q9Y296 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC4Q9Y296 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC4Q9Y296 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC4Q9Y296 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC4Q9Y296 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAPPC4Q9Y296 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAPPC4Q9Y296 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAPPC4Q9Y296 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAPPC4Q9Y296 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAPPC4Q9Y296 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms