Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW5

AGTPBP1, Cytosolic carboxypeptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGTPBP1Q9UPW5 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
AGTPBP1Q9UPW5 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
AGTPBP1Q9UPW5 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
AGTPBP1Q9UPW5 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
AGTPBP1Q9UPW5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
AGTPBP1Q9UPW5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
AGTPBP1Q9UPW5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
AGTPBP1Q9UPW5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
AGTPBP1Q9UPW5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
AGTPBP1Q9UPW5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
AGTPBP1Q9UPW5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
AGTPBP1Q9UPW5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
AGTPBP1Q9UPW5 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
AGTPBP1Q9UPW5 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
AGTPBP1Q9UPW5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
AGTPBP1Q9UPW5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
AGTPBP1Q9UPW5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
AGTPBP1Q9UPW5 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
AGTPBP1Q9UPW5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
AGTPBP1Q9UPW5 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
AGTPBP1Q9UPW5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
AGTPBP1Q9UPW5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
AGTPBP1Q9UPW5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
AGTPBP1Q9UPW5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
AGTPBP1Q9UPW5 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
AGTPBP1Q9UPW5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
AGTPBP1Q9UPW5 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
AGTPBP1Q9UPW5 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
AGTPBP1Q9UPW5 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
AGTPBP1Q9UPW5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
AGTPBP1Q9UPW5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
AGTPBP1Q9UPW5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
AGTPBP1Q9UPW5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
AGTPBP1Q9UPW5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
AGTPBP1Q9UPW5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
AGTPBP1Q9UPW5 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
AGTPBP1Q9UPW5 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
AGTPBP1Q9UPW5 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
AGTPBP1Q9UPW5 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
AGTPBP1Q9UPW5 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
AGTPBP1Q9UPW5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
AGTPBP1Q9UPW5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
AGTPBP1Q9UPW5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
AGTPBP1Q9UPW5 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
AGTPBP1Q9UPW5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
AGTPBP1Q9UPW5 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
AGTPBP1Q9UPW5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
AGTPBP1Q9UPW5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
AGTPBP1Q9UPW5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
AGTPBP1Q9UPW5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
AGTPBP1Q9UPW5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
AGTPBP1Q9UPW5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
AGTPBP1Q9UPW5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
AGTPBP1Q9UPW5 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
AGTPBP1Q9UPW5 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
AGTPBP1Q9UPW5 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
AGTPBP1Q9UPW5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
AGTPBP1Q9UPW5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
AGTPBP1Q9UPW5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
AGTPBP1Q9UPW5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
AGTPBP1Q9UPW5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
AGTPBP1Q9UPW5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
AGTPBP1Q9UPW5 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
AGTPBP1Q9UPW5 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
AGTPBP1Q9UPW5 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
AGTPBP1Q9UPW5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
AGTPBP1Q9UPW5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
AGTPBP1Q9UPW5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
AGTPBP1Q9UPW5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
AGTPBP1Q9UPW5 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
AGTPBP1Q9UPW5 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
AGTPBP1Q9UPW5 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
AGTPBP1Q9UPW5 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
AGTPBP1Q9UPW5 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
AGTPBP1Q9UPW5 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
AGTPBP1Q9UPW5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
AGTPBP1Q9UPW5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
AGTPBP1Q9UPW5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
AGTPBP1Q9UPW5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
AGTPBP1Q9UPW5 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
AGTPBP1Q9UPW5 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
AGTPBP1Q9UPW5 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
AGTPBP1Q9UPW5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
AGTPBP1Q9UPW5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
AGTPBP1Q9UPW5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
AGTPBP1Q9UPW5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
AGTPBP1Q9UPW5 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
AGTPBP1Q9UPW5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
AGTPBP1Q9UPW5 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
AGTPBP1Q9UPW5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
AGTPBP1Q9UPW5 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
AGTPBP1Q9UPW5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
AGTPBP1Q9UPW5 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
AGTPBP1Q9UPW5 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
AGTPBP1Q9UPW5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
AGTPBP1Q9UPW5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
AGTPBP1Q9UPW5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
AGTPBP1Q9UPW5 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
AGTPBP1Q9UPW5 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
AGTPBP1Q9UPW5 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms