Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN30

SCML1, Sex comb on midleg-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML1Q9UN30 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCML1Q9UN30 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCML1Q9UN30 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCML1Q9UN30 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCML1Q9UN30 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCML1Q9UN30 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCML1Q9UN30 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCML1Q9UN30 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCML1Q9UN30 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCML1Q9UN30 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCML1Q9UN30 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCML1Q9UN30 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCML1Q9UN30 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCML1Q9UN30 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCML1Q9UN30 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCML1Q9UN30 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCML1Q9UN30 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCML1Q9UN30 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCML1Q9UN30 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCML1Q9UN30 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCML1Q9UN30 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCML1Q9UN30 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCML1Q9UN30 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCML1Q9UN30 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCML1Q9UN30 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCML1Q9UN30 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCML1Q9UN30 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCML1Q9UN30 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCML1Q9UN30 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCML1Q9UN30 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCML1Q9UN30 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCML1Q9UN30 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCML1Q9UN30 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCML1Q9UN30 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCML1Q9UN30 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCML1Q9UN30 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCML1Q9UN30 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCML1Q9UN30 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCML1Q9UN30 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCML1Q9UN30 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCML1Q9UN30 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCML1Q9UN30 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCML1Q9UN30 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCML1Q9UN30 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCML1Q9UN30 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCML1Q9UN30 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCML1Q9UN30 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCML1Q9UN30 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCML1Q9UN30 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCML1Q9UN30 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCML1Q9UN30 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCML1Q9UN30 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCML1Q9UN30 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SCML1Q9UN30 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCML1Q9UN30 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCML1Q9UN30 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCML1Q9UN30 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCML1Q9UN30 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCML1Q9UN30 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCML1Q9UN30 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCML1Q9UN30 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SCML1Q9UN30 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCML1Q9UN30 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCML1Q9UN30 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCML1Q9UN30 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCML1Q9UN30 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCML1Q9UN30 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCML1Q9UN30 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCML1Q9UN30 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCML1Q9UN30 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCML1Q9UN30 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCML1Q9UN30 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCML1Q9UN30 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCML1Q9UN30 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCML1Q9UN30 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCML1Q9UN30 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCML1Q9UN30 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCML1Q9UN30 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCML1Q9UN30 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCML1Q9UN30 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCML1Q9UN30 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCML1Q9UN30 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCML1Q9UN30 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCML1Q9UN30 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SCML1Q9UN30 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCML1Q9UN30 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCML1Q9UN30 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCML1Q9UN30 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCML1Q9UN30 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCML1Q9UN30 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCML1Q9UN30 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCML1Q9UN30 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCML1Q9UN30 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCML1Q9UN30 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCML1Q9UN30 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCML1Q9UN30 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SCML1Q9UN30 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCML1Q9UN30 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SCML1Q9UN30 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SCML1Q9UN30 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms