Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS4

PRPF19, Pre-mRNA-processing factor 19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF19Q9UMS4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRPF19Q9UMS4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRPF19Q9UMS4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRPF19Q9UMS4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRPF19Q9UMS4 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRPF19Q9UMS4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRPF19Q9UMS4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRPF19Q9UMS4 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRPF19Q9UMS4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRPF19Q9UMS4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRPF19Q9UMS4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRPF19Q9UMS4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRPF19Q9UMS4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRPF19Q9UMS4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRPF19Q9UMS4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRPF19Q9UMS4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRPF19Q9UMS4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRPF19Q9UMS4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
PRPF19Q9UMS4 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRPF19Q9UMS4 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRPF19Q9UMS4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRPF19Q9UMS4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRPF19Q9UMS4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRPF19Q9UMS4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRPF19Q9UMS4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRPF19Q9UMS4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRPF19Q9UMS4 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRPF19Q9UMS4 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRPF19Q9UMS4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRPF19Q9UMS4 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRPF19Q9UMS4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRPF19Q9UMS4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PRPF19Q9UMS4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRPF19Q9UMS4 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRPF19Q9UMS4 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRPF19Q9UMS4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRPF19Q9UMS4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRPF19Q9UMS4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRPF19Q9UMS4 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRPF19Q9UMS4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRPF19Q9UMS4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRPF19Q9UMS4 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRPF19Q9UMS4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRPF19Q9UMS4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRPF19Q9UMS4 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRPF19Q9UMS4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRPF19Q9UMS4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRPF19Q9UMS4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRPF19Q9UMS4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRPF19Q9UMS4 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRPF19Q9UMS4 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRPF19Q9UMS4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRPF19Q9UMS4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PRPF19Q9UMS4 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRPF19Q9UMS4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRPF19Q9UMS4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRPF19Q9UMS4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRPF19Q9UMS4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRPF19Q9UMS4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRPF19Q9UMS4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRPF19Q9UMS4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRPF19Q9UMS4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRPF19Q9UMS4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRPF19Q9UMS4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRPF19Q9UMS4 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRPF19Q9UMS4 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRPF19Q9UMS4 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRPF19Q9UMS4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRPF19Q9UMS4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRPF19Q9UMS4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRPF19Q9UMS4 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRPF19Q9UMS4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRPF19Q9UMS4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRPF19Q9UMS4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRPF19Q9UMS4 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRPF19Q9UMS4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRPF19Q9UMS4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRPF19Q9UMS4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRPF19Q9UMS4 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRPF19Q9UMS4 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRPF19Q9UMS4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRPF19Q9UMS4 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRPF19Q9UMS4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRPF19Q9UMS4 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PRPF19Q9UMS4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PRPF19Q9UMS4 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRPF19Q9UMS4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRPF19Q9UMS4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRPF19Q9UMS4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRPF19Q9UMS4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PRPF19Q9UMS4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PRPF19Q9UMS4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRPF19Q9UMS4 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRPF19Q9UMS4 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRPF19Q9UMS4 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRPF19Q9UMS4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRPF19Q9UMS4 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRPF19Q9UMS4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRPF19Q9UMS4 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRPF19Q9UMS4 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms