Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ99

CDH22, Cadherin-22, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH22Q9UJ99 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDH22Q9UJ99 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDH22Q9UJ99 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDH22Q9UJ99 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDH22Q9UJ99 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDH22Q9UJ99 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDH22Q9UJ99 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDH22Q9UJ99 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDH22Q9UJ99 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDH22Q9UJ99 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDH22Q9UJ99 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDH22Q9UJ99 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDH22Q9UJ99 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CDH22Q9UJ99 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDH22Q9UJ99 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDH22Q9UJ99 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDH22Q9UJ99 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDH22Q9UJ99 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDH22Q9UJ99 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDH22Q9UJ99 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDH22Q9UJ99 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CDH22Q9UJ99 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDH22Q9UJ99 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDH22Q9UJ99 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDH22Q9UJ99 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDH22Q9UJ99 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDH22Q9UJ99 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CDH22Q9UJ99 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CDH22Q9UJ99 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDH22Q9UJ99 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDH22Q9UJ99 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDH22Q9UJ99 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDH22Q9UJ99 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDH22Q9UJ99 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CDH22Q9UJ99 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDH22Q9UJ99 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CDH22Q9UJ99 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDH22Q9UJ99 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDH22Q9UJ99 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDH22Q9UJ99 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDH22Q9UJ99 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDH22Q9UJ99 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDH22Q9UJ99 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CDH22Q9UJ99 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDH22Q9UJ99 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDH22Q9UJ99 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDH22Q9UJ99 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDH22Q9UJ99 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDH22Q9UJ99 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDH22Q9UJ99 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDH22Q9UJ99 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDH22Q9UJ99 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDH22Q9UJ99 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDH22Q9UJ99 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDH22Q9UJ99 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDH22Q9UJ99 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDH22Q9UJ99 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDH22Q9UJ99 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDH22Q9UJ99 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDH22Q9UJ99 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDH22Q9UJ99 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDH22Q9UJ99 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDH22Q9UJ99 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDH22Q9UJ99 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH22Q9UJ99 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH22Q9UJ99 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH22Q9UJ99 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH22Q9UJ99 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH22Q9UJ99 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH22Q9UJ99 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH22Q9UJ99 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH22Q9UJ99 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH22Q9UJ99 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH22Q9UJ99 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH22Q9UJ99 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH22Q9UJ99 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH22Q9UJ99 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH22Q9UJ99 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH22Q9UJ99 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH22Q9UJ99 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH22Q9UJ99 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH22Q9UJ99 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH22Q9UJ99 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH22Q9UJ99 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH22Q9UJ99 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH22Q9UJ99 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH22Q9UJ99 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH22Q9UJ99 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH22Q9UJ99 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH22Q9UJ99 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH22Q9UJ99 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH22Q9UJ99 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH22Q9UJ99 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH22Q9UJ99 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH22Q9UJ99 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH22Q9UJ99 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH22Q9UJ99 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH22Q9UJ99 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH22Q9UJ99 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH22Q9UJ99 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms