Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MBD1Q9UIS9 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MBD1Q9UIS9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MBD1Q9UIS9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MBD1Q9UIS9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MBD1Q9UIS9 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MBD1Q9UIS9 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MBD1Q9UIS9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MBD1Q9UIS9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MBD1Q9UIS9 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MBD1Q9UIS9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MBD1Q9UIS9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MBD1Q9UIS9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MBD1Q9UIS9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MBD1Q9UIS9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MBD1Q9UIS9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MBD1Q9UIS9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MBD1Q9UIS9 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MBD1Q9UIS9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MBD1Q9UIS9 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MBD1Q9UIS9 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MBD1Q9UIS9 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MBD1Q9UIS9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MBD1Q9UIS9 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MBD1Q9UIS9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MBD1Q9UIS9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MBD1Q9UIS9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MBD1Q9UIS9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MBD1Q9UIS9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MBD1Q9UIS9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MBD1Q9UIS9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MBD1Q9UIS9 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MBD1Q9UIS9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MBD1Q9UIS9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MBD1Q9UIS9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MBD1Q9UIS9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MBD1Q9UIS9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MBD1Q9UIS9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MBD1Q9UIS9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MBD1Q9UIS9 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MBD1Q9UIS9 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MBD1Q9UIS9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MBD1Q9UIS9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MBD1Q9UIS9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MBD1Q9UIS9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MBD1Q9UIS9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MBD1Q9UIS9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MBD1Q9UIS9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MBD1Q9UIS9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MBD1Q9UIS9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MBD1Q9UIS9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MBD1Q9UIS9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MBD1Q9UIS9 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MBD1Q9UIS9 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MBD1Q9UIS9 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MBD1Q9UIS9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MBD1Q9UIS9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MBD1Q9UIS9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MBD1Q9UIS9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MBD1Q9UIS9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MBD1Q9UIS9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MBD1Q9UIS9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MBD1Q9UIS9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MBD1Q9UIS9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MBD1Q9UIS9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MBD1Q9UIS9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MBD1Q9UIS9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MBD1Q9UIS9 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MBD1Q9UIS9 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MBD1Q9UIS9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MBD1Q9UIS9 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MBD1Q9UIS9 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MBD1Q9UIS9 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MBD1Q9UIS9 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MBD1Q9UIS9 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MBD1Q9UIS9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MBD1Q9UIS9 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MBD1Q9UIS9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MBD1Q9UIS9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MBD1Q9UIS9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MBD1Q9UIS9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MBD1Q9UIS9 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MBD1Q9UIS9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MBD1Q9UIS9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MBD1Q9UIS9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MBD1Q9UIS9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MBD1Q9UIS9 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MBD1Q9UIS9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MBD1Q9UIS9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MBD1Q9UIS9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MBD1Q9UIS9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MBD1Q9UIS9 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MBD1Q9UIS9 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MBD1Q9UIS9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MBD1Q9UIS9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MBD1Q9UIS9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MBD1Q9UIS9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MBD1Q9UIS9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MBD1Q9UIS9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MBD1Q9UIS9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms