Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CTNNA3Q9UI47 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CTNNA3Q9UI47 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CTNNA3Q9UI47 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CTNNA3Q9UI47 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CTNNA3Q9UI47 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CTNNA3Q9UI47 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CTNNA3Q9UI47 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CTNNA3Q9UI47 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CTNNA3Q9UI47 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CTNNA3Q9UI47 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CTNNA3Q9UI47 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CTNNA3Q9UI47 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CTNNA3Q9UI47 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CTNNA3Q9UI47 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CTNNA3Q9UI47 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CTNNA3Q9UI47 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CTNNA3Q9UI47 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CTNNA3Q9UI47 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CTNNA3Q9UI47 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CTNNA3Q9UI47 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CTNNA3Q9UI47 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CTNNA3Q9UI47 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CTNNA3Q9UI47 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CTNNA3Q9UI47 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CTNNA3Q9UI47 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CTNNA3Q9UI47 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CTNNA3Q9UI47 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CTNNA3Q9UI47 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CTNNA3Q9UI47 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CTNNA3Q9UI47 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CTNNA3Q9UI47 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CTNNA3Q9UI47 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CTNNA3Q9UI47 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CTNNA3Q9UI47 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CTNNA3Q9UI47 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CTNNA3Q9UI47 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CTNNA3Q9UI47 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CTNNA3Q9UI47 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CTNNA3Q9UI47 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CTNNA3Q9UI47 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CTNNA3Q9UI47 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CTNNA3Q9UI47 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CTNNA3Q9UI47 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CTNNA3Q9UI47 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CTNNA3Q9UI47 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CTNNA3Q9UI47 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CTNNA3Q9UI47 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CTNNA3Q9UI47 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CTNNA3Q9UI47 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CTNNA3Q9UI47 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CTNNA3Q9UI47 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CTNNA3Q9UI47 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CTNNA3Q9UI47 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CTNNA3Q9UI47 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CTNNA3Q9UI47 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CTNNA3Q9UI47 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CTNNA3Q9UI47 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CTNNA3Q9UI47 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CTNNA3Q9UI47 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CTNNA3Q9UI47 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CTNNA3Q9UI47 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CTNNA3Q9UI47 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CTNNA3Q9UI47 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CTNNA3Q9UI47 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CTNNA3Q9UI47 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CTNNA3Q9UI47 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CTNNA3Q9UI47 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CTNNA3Q9UI47 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CTNNA3Q9UI47 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CTNNA3Q9UI47 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CTNNA3Q9UI47 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CTNNA3Q9UI47 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CTNNA3Q9UI47 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CTNNA3Q9UI47 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CTNNA3Q9UI47 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CTNNA3Q9UI47 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CTNNA3Q9UI47 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CTNNA3Q9UI47 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CTNNA3Q9UI47 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CTNNA3Q9UI47 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CTNNA3Q9UI47 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CTNNA3Q9UI47 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CTNNA3Q9UI47 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CTNNA3Q9UI47 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CTNNA3Q9UI47 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CTNNA3Q9UI47 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CTNNA3Q9UI47 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CTNNA3Q9UI47 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CTNNA3Q9UI47 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CTNNA3Q9UI47 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CTNNA3Q9UI47 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CTNNA3Q9UI47 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CTNNA3Q9UI47 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CTNNA3Q9UI47 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CTNNA3Q9UI47 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CTNNA3Q9UI47 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTNNA3Q9UI47 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTNNA3Q9UI47 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CTNNA3Q9UI47 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms