Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF2IRD1Q9UHL9 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF2IRD1Q9UHL9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF2IRD1Q9UHL9 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF2IRD1Q9UHL9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF2IRD1Q9UHL9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF2IRD1Q9UHL9 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF2IRD1Q9UHL9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF2IRD1Q9UHL9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF2IRD1Q9UHL9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF2IRD1Q9UHL9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF2IRD1Q9UHL9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF2IRD1Q9UHL9 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF2IRD1Q9UHL9 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF2IRD1Q9UHL9 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF2IRD1Q9UHL9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF2IRD1Q9UHL9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF2IRD1Q9UHL9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF2IRD1Q9UHL9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF2IRD1Q9UHL9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF2IRD1Q9UHL9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF2IRD1Q9UHL9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF2IRD1Q9UHL9 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF2IRD1Q9UHL9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF2IRD1Q9UHL9 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF2IRD1Q9UHL9 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF2IRD1Q9UHL9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF2IRD1Q9UHL9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF2IRD1Q9UHL9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF2IRD1Q9UHL9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF2IRD1Q9UHL9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF2IRD1Q9UHL9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF2IRD1Q9UHL9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF2IRD1Q9UHL9 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF2IRD1Q9UHL9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF2IRD1Q9UHL9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF2IRD1Q9UHL9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF2IRD1Q9UHL9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF2IRD1Q9UHL9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF2IRD1Q9UHL9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF2IRD1Q9UHL9 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF2IRD1Q9UHL9 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF2IRD1Q9UHL9 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF2IRD1Q9UHL9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF2IRD1Q9UHL9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF2IRD1Q9UHL9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF2IRD1Q9UHL9 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF2IRD1Q9UHL9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF2IRD1Q9UHL9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF2IRD1Q9UHL9 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF2IRD1Q9UHL9 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF2IRD1Q9UHL9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF2IRD1Q9UHL9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF2IRD1Q9UHL9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GTF2IRD1Q9UHL9 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
GTF2IRD1Q9UHL9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GTF2IRD1Q9UHL9 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GTF2IRD1Q9UHL9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GTF2IRD1Q9UHL9 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GTF2IRD1Q9UHL9 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GTF2IRD1Q9UHL9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GTF2IRD1Q9UHL9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GTF2IRD1Q9UHL9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF2IRD1Q9UHL9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF2IRD1Q9UHL9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF2IRD1Q9UHL9 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF2IRD1Q9UHL9 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF2IRD1Q9UHL9 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF2IRD1Q9UHL9 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF2IRD1Q9UHL9 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF2IRD1Q9UHL9 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF2IRD1Q9UHL9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF2IRD1Q9UHL9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF2IRD1Q9UHL9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF2IRD1Q9UHL9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF2IRD1Q9UHL9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF2IRD1Q9UHL9 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF2IRD1Q9UHL9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF2IRD1Q9UHL9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF2IRD1Q9UHL9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF2IRD1Q9UHL9 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF2IRD1Q9UHL9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF2IRD1Q9UHL9 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF2IRD1Q9UHL9 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF2IRD1Q9UHL9 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF2IRD1Q9UHL9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF2IRD1Q9UHL9 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF2IRD1Q9UHL9 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF2IRD1Q9UHL9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms