Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEU0

VTI1B, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1BQ9UEU0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
VTI1BQ9UEU0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VTI1BQ9UEU0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VTI1BQ9UEU0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VTI1BQ9UEU0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VTI1BQ9UEU0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VTI1BQ9UEU0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VTI1BQ9UEU0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VTI1BQ9UEU0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VTI1BQ9UEU0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VTI1BQ9UEU0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VTI1BQ9UEU0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VTI1BQ9UEU0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VTI1BQ9UEU0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VTI1BQ9UEU0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VTI1BQ9UEU0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VTI1BQ9UEU0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VTI1BQ9UEU0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VTI1BQ9UEU0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VTI1BQ9UEU0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VTI1BQ9UEU0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VTI1BQ9UEU0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VTI1BQ9UEU0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VTI1BQ9UEU0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VTI1BQ9UEU0 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VTI1BQ9UEU0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VTI1BQ9UEU0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VTI1BQ9UEU0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VTI1BQ9UEU0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VTI1BQ9UEU0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VTI1BQ9UEU0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VTI1BQ9UEU0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
VTI1BQ9UEU0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VTI1BQ9UEU0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VTI1BQ9UEU0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VTI1BQ9UEU0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VTI1BQ9UEU0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VTI1BQ9UEU0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VTI1BQ9UEU0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VTI1BQ9UEU0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VTI1BQ9UEU0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VTI1BQ9UEU0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VTI1BQ9UEU0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VTI1BQ9UEU0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VTI1BQ9UEU0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VTI1BQ9UEU0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VTI1BQ9UEU0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VTI1BQ9UEU0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VTI1BQ9UEU0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VTI1BQ9UEU0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
VTI1BQ9UEU0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VTI1BQ9UEU0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VTI1BQ9UEU0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VTI1BQ9UEU0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VTI1BQ9UEU0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VTI1BQ9UEU0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VTI1BQ9UEU0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VTI1BQ9UEU0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VTI1BQ9UEU0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VTI1BQ9UEU0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VTI1BQ9UEU0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VTI1BQ9UEU0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VTI1BQ9UEU0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VTI1BQ9UEU0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VTI1BQ9UEU0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VTI1BQ9UEU0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VTI1BQ9UEU0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
VTI1BQ9UEU0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VTI1BQ9UEU0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VTI1BQ9UEU0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
VTI1BQ9UEU0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VTI1BQ9UEU0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VTI1BQ9UEU0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
VTI1BQ9UEU0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VTI1BQ9UEU0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VTI1BQ9UEU0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
VTI1BQ9UEU0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VTI1BQ9UEU0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
VTI1BQ9UEU0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VTI1BQ9UEU0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VTI1BQ9UEU0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VTI1BQ9UEU0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VTI1BQ9UEU0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VTI1BQ9UEU0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VTI1BQ9UEU0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VTI1BQ9UEU0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VTI1BQ9UEU0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VTI1BQ9UEU0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VTI1BQ9UEU0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VTI1BQ9UEU0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VTI1BQ9UEU0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VTI1BQ9UEU0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VTI1BQ9UEU0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VTI1BQ9UEU0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VTI1BQ9UEU0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VTI1BQ9UEU0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VTI1BQ9UEU0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VTI1BQ9UEU0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VTI1BQ9UEU0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VTI1BQ9UEU0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms