Protein–RNA interactions for Protein: Q9P031

CCDC59, Thyroid transcription factor 1-associated protein 26, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC59Q9P031 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC59Q9P031 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC59Q9P031 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC59Q9P031 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC59Q9P031 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC59Q9P031 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC59Q9P031 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC59Q9P031 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC59Q9P031 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC59Q9P031 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC59Q9P031 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC59Q9P031 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC59Q9P031 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC59Q9P031 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC59Q9P031 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC59Q9P031 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC59Q9P031 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC59Q9P031 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC59Q9P031 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC59Q9P031 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC59Q9P031 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC59Q9P031 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC59Q9P031 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC59Q9P031 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC59Q9P031 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC59Q9P031 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC59Q9P031 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC59Q9P031 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC59Q9P031 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC59Q9P031 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC59Q9P031 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC59Q9P031 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC59Q9P031 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC59Q9P031 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC59Q9P031 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC59Q9P031 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC59Q9P031 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC59Q9P031 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC59Q9P031 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC59Q9P031 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC59Q9P031 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC59Q9P031 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC59Q9P031 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC59Q9P031 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC59Q9P031 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC59Q9P031 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC59Q9P031 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC59Q9P031 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC59Q9P031 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC59Q9P031 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC59Q9P031 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC59Q9P031 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC59Q9P031 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC59Q9P031 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC59Q9P031 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC59Q9P031 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC59Q9P031 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC59Q9P031 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC59Q9P031 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC59Q9P031 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC59Q9P031 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC59Q9P031 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC59Q9P031 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC59Q9P031 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC59Q9P031 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC59Q9P031 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC59Q9P031 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC59Q9P031 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC59Q9P031 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC59Q9P031 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC59Q9P031 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC59Q9P031 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC59Q9P031 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC59Q9P031 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC59Q9P031 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC59Q9P031 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC59Q9P031 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC59Q9P031 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC59Q9P031 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CCDC59Q9P031 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CCDC59Q9P031 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CCDC59Q9P031 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CCDC59Q9P031 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC59Q9P031 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC59Q9P031 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC59Q9P031 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC59Q9P031 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC59Q9P031 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC59Q9P031 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC59Q9P031 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC59Q9P031 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC59Q9P031 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC59Q9P031 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC59Q9P031 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC59Q9P031 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC59Q9P031 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC59Q9P031 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC59Q9P031 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC59Q9P031 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC59Q9P031 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms