Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GDE1Q9NZC3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GDE1Q9NZC3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GDE1Q9NZC3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GDE1Q9NZC3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GDE1Q9NZC3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GDE1Q9NZC3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GDE1Q9NZC3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GDE1Q9NZC3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GDE1Q9NZC3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GDE1Q9NZC3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GDE1Q9NZC3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GDE1Q9NZC3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GDE1Q9NZC3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GDE1Q9NZC3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GDE1Q9NZC3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GDE1Q9NZC3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GDE1Q9NZC3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GDE1Q9NZC3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GDE1Q9NZC3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GDE1Q9NZC3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GDE1Q9NZC3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GDE1Q9NZC3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GDE1Q9NZC3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GDE1Q9NZC3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GDE1Q9NZC3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GDE1Q9NZC3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GDE1Q9NZC3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GDE1Q9NZC3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GDE1Q9NZC3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GDE1Q9NZC3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GDE1Q9NZC3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GDE1Q9NZC3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GDE1Q9NZC3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GDE1Q9NZC3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GDE1Q9NZC3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GDE1Q9NZC3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GDE1Q9NZC3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GDE1Q9NZC3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GDE1Q9NZC3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GDE1Q9NZC3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GDE1Q9NZC3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GDE1Q9NZC3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GDE1Q9NZC3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GDE1Q9NZC3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GDE1Q9NZC3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GDE1Q9NZC3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GDE1Q9NZC3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GDE1Q9NZC3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GDE1Q9NZC3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GDE1Q9NZC3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GDE1Q9NZC3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GDE1Q9NZC3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GDE1Q9NZC3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GDE1Q9NZC3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GDE1Q9NZC3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GDE1Q9NZC3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GDE1Q9NZC3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GDE1Q9NZC3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GDE1Q9NZC3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GDE1Q9NZC3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GDE1Q9NZC3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GDE1Q9NZC3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GDE1Q9NZC3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GDE1Q9NZC3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GDE1Q9NZC3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GDE1Q9NZC3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GDE1Q9NZC3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GDE1Q9NZC3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GDE1Q9NZC3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GDE1Q9NZC3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GDE1Q9NZC3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GDE1Q9NZC3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GDE1Q9NZC3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GDE1Q9NZC3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GDE1Q9NZC3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GDE1Q9NZC3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GDE1Q9NZC3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GDE1Q9NZC3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GDE1Q9NZC3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GDE1Q9NZC3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GDE1Q9NZC3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GDE1Q9NZC3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GDE1Q9NZC3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GDE1Q9NZC3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GDE1Q9NZC3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GDE1Q9NZC3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GDE1Q9NZC3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GDE1Q9NZC3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GDE1Q9NZC3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GDE1Q9NZC3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GDE1Q9NZC3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDE1Q9NZC3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDE1Q9NZC3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDE1Q9NZC3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDE1Q9NZC3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDE1Q9NZC3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GDE1Q9NZC3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDE1Q9NZC3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDE1Q9NZC3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
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