Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVD3

SETD4, SET domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD4Q9NVD3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SETD4Q9NVD3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SETD4Q9NVD3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SETD4Q9NVD3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SETD4Q9NVD3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SETD4Q9NVD3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SETD4Q9NVD3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SETD4Q9NVD3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SETD4Q9NVD3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SETD4Q9NVD3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SETD4Q9NVD3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SETD4Q9NVD3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SETD4Q9NVD3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SETD4Q9NVD3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SETD4Q9NVD3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SETD4Q9NVD3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SETD4Q9NVD3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SETD4Q9NVD3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SETD4Q9NVD3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SETD4Q9NVD3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SETD4Q9NVD3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SETD4Q9NVD3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SETD4Q9NVD3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SETD4Q9NVD3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SETD4Q9NVD3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SETD4Q9NVD3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SETD4Q9NVD3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SETD4Q9NVD3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SETD4Q9NVD3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SETD4Q9NVD3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SETD4Q9NVD3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SETD4Q9NVD3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SETD4Q9NVD3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SETD4Q9NVD3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SETD4Q9NVD3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SETD4Q9NVD3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SETD4Q9NVD3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SETD4Q9NVD3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SETD4Q9NVD3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SETD4Q9NVD3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SETD4Q9NVD3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SETD4Q9NVD3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SETD4Q9NVD3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SETD4Q9NVD3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SETD4Q9NVD3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SETD4Q9NVD3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SETD4Q9NVD3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SETD4Q9NVD3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SETD4Q9NVD3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SETD4Q9NVD3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SETD4Q9NVD3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SETD4Q9NVD3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SETD4Q9NVD3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SETD4Q9NVD3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SETD4Q9NVD3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SETD4Q9NVD3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SETD4Q9NVD3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SETD4Q9NVD3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SETD4Q9NVD3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SETD4Q9NVD3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SETD4Q9NVD3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SETD4Q9NVD3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SETD4Q9NVD3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SETD4Q9NVD3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SETD4Q9NVD3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SETD4Q9NVD3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SETD4Q9NVD3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SETD4Q9NVD3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SETD4Q9NVD3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SETD4Q9NVD3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SETD4Q9NVD3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SETD4Q9NVD3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SETD4Q9NVD3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SETD4Q9NVD3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SETD4Q9NVD3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SETD4Q9NVD3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SETD4Q9NVD3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SETD4Q9NVD3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SETD4Q9NVD3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SETD4Q9NVD3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SETD4Q9NVD3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SETD4Q9NVD3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SETD4Q9NVD3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SETD4Q9NVD3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SETD4Q9NVD3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SETD4Q9NVD3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SETD4Q9NVD3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SETD4Q9NVD3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SETD4Q9NVD3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SETD4Q9NVD3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SETD4Q9NVD3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SETD4Q9NVD3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SETD4Q9NVD3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SETD4Q9NVD3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SETD4Q9NVD3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SETD4Q9NVD3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SETD4Q9NVD3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SETD4Q9NVD3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SETD4Q9NVD3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SETD4Q9NVD3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms