Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR12

PDLIM7, PDZ and LIM domain protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM7Q9NR12 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDLIM7Q9NR12 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDLIM7Q9NR12 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDLIM7Q9NR12 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDLIM7Q9NR12 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDLIM7Q9NR12 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDLIM7Q9NR12 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDLIM7Q9NR12 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDLIM7Q9NR12 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDLIM7Q9NR12 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDLIM7Q9NR12 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDLIM7Q9NR12 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDLIM7Q9NR12 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PDLIM7Q9NR12 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PDLIM7Q9NR12 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDLIM7Q9NR12 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDLIM7Q9NR12 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDLIM7Q9NR12 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDLIM7Q9NR12 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDLIM7Q9NR12 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PDLIM7Q9NR12 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDLIM7Q9NR12 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PDLIM7Q9NR12 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PDLIM7Q9NR12 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDLIM7Q9NR12 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDLIM7Q9NR12 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDLIM7Q9NR12 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDLIM7Q9NR12 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDLIM7Q9NR12 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDLIM7Q9NR12 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDLIM7Q9NR12 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDLIM7Q9NR12 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDLIM7Q9NR12 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PDLIM7Q9NR12 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PDLIM7Q9NR12 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDLIM7Q9NR12 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDLIM7Q9NR12 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDLIM7Q9NR12 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDLIM7Q9NR12 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDLIM7Q9NR12 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDLIM7Q9NR12 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDLIM7Q9NR12 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDLIM7Q9NR12 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDLIM7Q9NR12 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDLIM7Q9NR12 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDLIM7Q9NR12 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDLIM7Q9NR12 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDLIM7Q9NR12 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDLIM7Q9NR12 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDLIM7Q9NR12 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDLIM7Q9NR12 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDLIM7Q9NR12 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDLIM7Q9NR12 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDLIM7Q9NR12 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDLIM7Q9NR12 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PDLIM7Q9NR12 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDLIM7Q9NR12 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDLIM7Q9NR12 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDLIM7Q9NR12 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDLIM7Q9NR12 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDLIM7Q9NR12 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PDLIM7Q9NR12 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDLIM7Q9NR12 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDLIM7Q9NR12 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDLIM7Q9NR12 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDLIM7Q9NR12 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDLIM7Q9NR12 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDLIM7Q9NR12 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDLIM7Q9NR12 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDLIM7Q9NR12 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDLIM7Q9NR12 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDLIM7Q9NR12 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDLIM7Q9NR12 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDLIM7Q9NR12 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDLIM7Q9NR12 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDLIM7Q9NR12 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDLIM7Q9NR12 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDLIM7Q9NR12 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDLIM7Q9NR12 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDLIM7Q9NR12 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDLIM7Q9NR12 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDLIM7Q9NR12 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDLIM7Q9NR12 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDLIM7Q9NR12 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDLIM7Q9NR12 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDLIM7Q9NR12 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PDLIM7Q9NR12 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PDLIM7Q9NR12 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDLIM7Q9NR12 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDLIM7Q9NR12 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
PDLIM7Q9NR12 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDLIM7Q9NR12 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDLIM7Q9NR12 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDLIM7Q9NR12 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDLIM7Q9NR12 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDLIM7Q9NR12 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDLIM7Q9NR12 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDLIM7Q9NR12 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDLIM7Q9NR12 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDLIM7Q9NR12 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms