Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ARFGAP3Q9NP61 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARFGAP3Q9NP61 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARFGAP3Q9NP61 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ARFGAP3Q9NP61 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARFGAP3Q9NP61 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ARFGAP3Q9NP61 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ARFGAP3Q9NP61 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ARFGAP3Q9NP61 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ARFGAP3Q9NP61 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ARFGAP3Q9NP61 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARFGAP3Q9NP61 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARFGAP3Q9NP61 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARFGAP3Q9NP61 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARFGAP3Q9NP61 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARFGAP3Q9NP61 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARFGAP3Q9NP61 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARFGAP3Q9NP61 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARFGAP3Q9NP61 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARFGAP3Q9NP61 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARFGAP3Q9NP61 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARFGAP3Q9NP61 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARFGAP3Q9NP61 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARFGAP3Q9NP61 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARFGAP3Q9NP61 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARFGAP3Q9NP61 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARFGAP3Q9NP61 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARFGAP3Q9NP61 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARFGAP3Q9NP61 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARFGAP3Q9NP61 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARFGAP3Q9NP61 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARFGAP3Q9NP61 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARFGAP3Q9NP61 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARFGAP3Q9NP61 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARFGAP3Q9NP61 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARFGAP3Q9NP61 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ARFGAP3Q9NP61 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARFGAP3Q9NP61 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARFGAP3Q9NP61 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARFGAP3Q9NP61 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARFGAP3Q9NP61 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARFGAP3Q9NP61 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARFGAP3Q9NP61 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARFGAP3Q9NP61 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARFGAP3Q9NP61 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARFGAP3Q9NP61 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARFGAP3Q9NP61 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARFGAP3Q9NP61 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARFGAP3Q9NP61 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARFGAP3Q9NP61 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARFGAP3Q9NP61 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARFGAP3Q9NP61 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARFGAP3Q9NP61 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARFGAP3Q9NP61 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARFGAP3Q9NP61 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARFGAP3Q9NP61 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ARFGAP3Q9NP61 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARFGAP3Q9NP61 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARFGAP3Q9NP61 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARFGAP3Q9NP61 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARFGAP3Q9NP61 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARFGAP3Q9NP61 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARFGAP3Q9NP61 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARFGAP3Q9NP61 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARFGAP3Q9NP61 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARFGAP3Q9NP61 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARFGAP3Q9NP61 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARFGAP3Q9NP61 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ARFGAP3Q9NP61 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARFGAP3Q9NP61 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARFGAP3Q9NP61 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARFGAP3Q9NP61 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARFGAP3Q9NP61 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARFGAP3Q9NP61 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARFGAP3Q9NP61 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARFGAP3Q9NP61 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARFGAP3Q9NP61 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARFGAP3Q9NP61 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARFGAP3Q9NP61 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARFGAP3Q9NP61 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARFGAP3Q9NP61 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARFGAP3Q9NP61 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARFGAP3Q9NP61 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ARFGAP3Q9NP61 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARFGAP3Q9NP61 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARFGAP3Q9NP61 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARFGAP3Q9NP61 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARFGAP3Q9NP61 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ARFGAP3Q9NP61 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ARFGAP3Q9NP61 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARFGAP3Q9NP61 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARFGAP3Q9NP61 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARFGAP3Q9NP61 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARFGAP3Q9NP61 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARFGAP3Q9NP61 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARFGAP3Q9NP61 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARFGAP3Q9NP61 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARFGAP3Q9NP61 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARFGAP3Q9NP61 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARFGAP3Q9NP61 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms