Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9K5

ERVMER34-1, Endogenous retrovirus group MER34 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVMER34-1Q9H9K5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVMER34-1Q9H9K5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVMER34-1Q9H9K5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVMER34-1Q9H9K5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVMER34-1Q9H9K5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ERVMER34-1Q9H9K5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ERVMER34-1Q9H9K5 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ERVMER34-1Q9H9K5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERVMER34-1Q9H9K5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERVMER34-1Q9H9K5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERVMER34-1Q9H9K5 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERVMER34-1Q9H9K5 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERVMER34-1Q9H9K5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERVMER34-1Q9H9K5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERVMER34-1Q9H9K5 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERVMER34-1Q9H9K5 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ERVMER34-1Q9H9K5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERVMER34-1Q9H9K5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERVMER34-1Q9H9K5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERVMER34-1Q9H9K5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVMER34-1Q9H9K5 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVMER34-1Q9H9K5 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVMER34-1Q9H9K5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVMER34-1Q9H9K5 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVMER34-1Q9H9K5 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVMER34-1Q9H9K5 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVMER34-1Q9H9K5 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVMER34-1Q9H9K5 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVMER34-1Q9H9K5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVMER34-1Q9H9K5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVMER34-1Q9H9K5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVMER34-1Q9H9K5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVMER34-1Q9H9K5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVMER34-1Q9H9K5 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ERVMER34-1Q9H9K5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERVMER34-1Q9H9K5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERVMER34-1Q9H9K5 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ERVMER34-1Q9H9K5 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERVMER34-1Q9H9K5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERVMER34-1Q9H9K5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERVMER34-1Q9H9K5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERVMER34-1Q9H9K5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERVMER34-1Q9H9K5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERVMER34-1Q9H9K5 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVMER34-1Q9H9K5 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVMER34-1Q9H9K5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVMER34-1Q9H9K5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVMER34-1Q9H9K5 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVMER34-1Q9H9K5 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVMER34-1Q9H9K5 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVMER34-1Q9H9K5 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVMER34-1Q9H9K5 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVMER34-1Q9H9K5 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVMER34-1Q9H9K5 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVMER34-1Q9H9K5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVMER34-1Q9H9K5 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVMER34-1Q9H9K5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVMER34-1Q9H9K5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVMER34-1Q9H9K5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERVMER34-1Q9H9K5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERVMER34-1Q9H9K5 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERVMER34-1Q9H9K5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERVMER34-1Q9H9K5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERVMER34-1Q9H9K5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERVMER34-1Q9H9K5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERVMER34-1Q9H9K5 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERVMER34-1Q9H9K5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERVMER34-1Q9H9K5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVMER34-1Q9H9K5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVMER34-1Q9H9K5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVMER34-1Q9H9K5 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVMER34-1Q9H9K5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVMER34-1Q9H9K5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVMER34-1Q9H9K5 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVMER34-1Q9H9K5 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVMER34-1Q9H9K5 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVMER34-1Q9H9K5 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVMER34-1Q9H9K5 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVMER34-1Q9H9K5 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVMER34-1Q9H9K5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVMER34-1Q9H9K5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ERVMER34-1Q9H9K5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ERVMER34-1Q9H9K5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ERVMER34-1Q9H9K5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ERVMER34-1Q9H9K5 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ERVMER34-1Q9H9K5 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ERVMER34-1Q9H9K5 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ERVMER34-1Q9H9K5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ERVMER34-1Q9H9K5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ERVMER34-1Q9H9K5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ERVMER34-1Q9H9K5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ERVMER34-1Q9H9K5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVMER34-1Q9H9K5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVMER34-1Q9H9K5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVMER34-1Q9H9K5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVMER34-1Q9H9K5 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVMER34-1Q9H9K5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVMER34-1Q9H9K5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVMER34-1Q9H9K5 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVMER34-1Q9H9K5 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms