Protein–RNA interactions for Protein: Q9H799

C5orf42, Protein JBTS17, humanhuman

Predictions only

Length 3,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf42Q9H799 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C5orf42Q9H799 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C5orf42Q9H799 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C5orf42Q9H799 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C5orf42Q9H799 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C5orf42Q9H799 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C5orf42Q9H799 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C5orf42Q9H799 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C5orf42Q9H799 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
C5orf42Q9H799 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
C5orf42Q9H799 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C5orf42Q9H799 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C5orf42Q9H799 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C5orf42Q9H799 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C5orf42Q9H799 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C5orf42Q9H799 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C5orf42Q9H799 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C5orf42Q9H799 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C5orf42Q9H799 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C5orf42Q9H799 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C5orf42Q9H799 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C5orf42Q9H799 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C5orf42Q9H799 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C5orf42Q9H799 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
C5orf42Q9H799 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C5orf42Q9H799 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C5orf42Q9H799 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C5orf42Q9H799 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
C5orf42Q9H799 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C5orf42Q9H799 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C5orf42Q9H799 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C5orf42Q9H799 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C5orf42Q9H799 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C5orf42Q9H799 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C5orf42Q9H799 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
C5orf42Q9H799 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C5orf42Q9H799 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
C5orf42Q9H799 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C5orf42Q9H799 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C5orf42Q9H799 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C5orf42Q9H799 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C5orf42Q9H799 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C5orf42Q9H799 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C5orf42Q9H799 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C5orf42Q9H799 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
C5orf42Q9H799 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C5orf42Q9H799 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C5orf42Q9H799 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C5orf42Q9H799 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C5orf42Q9H799 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C5orf42Q9H799 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C5orf42Q9H799 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C5orf42Q9H799 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C5orf42Q9H799 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C5orf42Q9H799 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C5orf42Q9H799 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C5orf42Q9H799 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
C5orf42Q9H799 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
C5orf42Q9H799 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
C5orf42Q9H799 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C5orf42Q9H799 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C5orf42Q9H799 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
C5orf42Q9H799 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C5orf42Q9H799 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C5orf42Q9H799 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C5orf42Q9H799 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C5orf42Q9H799 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C5orf42Q9H799 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C5orf42Q9H799 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C5orf42Q9H799 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C5orf42Q9H799 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C5orf42Q9H799 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C5orf42Q9H799 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C5orf42Q9H799 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C5orf42Q9H799 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
C5orf42Q9H799 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C5orf42Q9H799 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C5orf42Q9H799 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C5orf42Q9H799 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C5orf42Q9H799 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C5orf42Q9H799 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C5orf42Q9H799 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C5orf42Q9H799 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C5orf42Q9H799 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C5orf42Q9H799 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C5orf42Q9H799 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C5orf42Q9H799 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C5orf42Q9H799 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C5orf42Q9H799 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C5orf42Q9H799 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C5orf42Q9H799 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C5orf42Q9H799 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C5orf42Q9H799 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C5orf42Q9H799 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
C5orf42Q9H799 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C5orf42Q9H799 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C5orf42Q9H799 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C5orf42Q9H799 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C5orf42Q9H799 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C5orf42Q9H799 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms