Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6Y2

WDR55, WD repeat-containing protein 55, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR55Q9H6Y2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
WDR55Q9H6Y2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
WDR55Q9H6Y2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
WDR55Q9H6Y2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
WDR55Q9H6Y2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
WDR55Q9H6Y2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
WDR55Q9H6Y2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
WDR55Q9H6Y2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
WDR55Q9H6Y2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
WDR55Q9H6Y2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
WDR55Q9H6Y2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
WDR55Q9H6Y2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
WDR55Q9H6Y2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
WDR55Q9H6Y2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
WDR55Q9H6Y2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
WDR55Q9H6Y2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
WDR55Q9H6Y2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
WDR55Q9H6Y2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
WDR55Q9H6Y2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
WDR55Q9H6Y2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
WDR55Q9H6Y2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
WDR55Q9H6Y2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
WDR55Q9H6Y2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
WDR55Q9H6Y2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
WDR55Q9H6Y2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
WDR55Q9H6Y2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
WDR55Q9H6Y2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
WDR55Q9H6Y2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
WDR55Q9H6Y2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
WDR55Q9H6Y2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
WDR55Q9H6Y2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
WDR55Q9H6Y2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
WDR55Q9H6Y2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
WDR55Q9H6Y2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
WDR55Q9H6Y2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
WDR55Q9H6Y2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
WDR55Q9H6Y2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
WDR55Q9H6Y2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
WDR55Q9H6Y2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
WDR55Q9H6Y2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
WDR55Q9H6Y2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
WDR55Q9H6Y2 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
WDR55Q9H6Y2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
WDR55Q9H6Y2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
WDR55Q9H6Y2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
WDR55Q9H6Y2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
WDR55Q9H6Y2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
WDR55Q9H6Y2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
WDR55Q9H6Y2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
WDR55Q9H6Y2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
WDR55Q9H6Y2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
WDR55Q9H6Y2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
WDR55Q9H6Y2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
WDR55Q9H6Y2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
WDR55Q9H6Y2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
WDR55Q9H6Y2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
WDR55Q9H6Y2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
WDR55Q9H6Y2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
WDR55Q9H6Y2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
WDR55Q9H6Y2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
WDR55Q9H6Y2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
WDR55Q9H6Y2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
WDR55Q9H6Y2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
WDR55Q9H6Y2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
WDR55Q9H6Y2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
WDR55Q9H6Y2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
WDR55Q9H6Y2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
WDR55Q9H6Y2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
WDR55Q9H6Y2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
WDR55Q9H6Y2 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
WDR55Q9H6Y2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
WDR55Q9H6Y2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
WDR55Q9H6Y2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
WDR55Q9H6Y2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
WDR55Q9H6Y2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
WDR55Q9H6Y2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
WDR55Q9H6Y2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
WDR55Q9H6Y2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
WDR55Q9H6Y2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
WDR55Q9H6Y2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
WDR55Q9H6Y2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
WDR55Q9H6Y2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
WDR55Q9H6Y2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
WDR55Q9H6Y2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
WDR55Q9H6Y2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
WDR55Q9H6Y2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
WDR55Q9H6Y2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
WDR55Q9H6Y2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
WDR55Q9H6Y2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
WDR55Q9H6Y2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
WDR55Q9H6Y2 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
WDR55Q9H6Y2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
WDR55Q9H6Y2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
WDR55Q9H6Y2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
WDR55Q9H6Y2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
WDR55Q9H6Y2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
WDR55Q9H6Y2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
WDR55Q9H6Y2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
WDR55Q9H6Y2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
WDR55Q9H6Y2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms