Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3N1

TMX1, Thioredoxin-related transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX1Q9H3N1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMX1Q9H3N1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMX1Q9H3N1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMX1Q9H3N1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMX1Q9H3N1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMX1Q9H3N1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TMX1Q9H3N1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMX1Q9H3N1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMX1Q9H3N1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMX1Q9H3N1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMX1Q9H3N1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMX1Q9H3N1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMX1Q9H3N1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMX1Q9H3N1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMX1Q9H3N1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMX1Q9H3N1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMX1Q9H3N1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMX1Q9H3N1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMX1Q9H3N1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMX1Q9H3N1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMX1Q9H3N1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMX1Q9H3N1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMX1Q9H3N1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMX1Q9H3N1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMX1Q9H3N1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMX1Q9H3N1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMX1Q9H3N1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMX1Q9H3N1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMX1Q9H3N1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TMX1Q9H3N1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMX1Q9H3N1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMX1Q9H3N1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TMX1Q9H3N1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TMX1Q9H3N1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMX1Q9H3N1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMX1Q9H3N1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMX1Q9H3N1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMX1Q9H3N1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMX1Q9H3N1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMX1Q9H3N1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMX1Q9H3N1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMX1Q9H3N1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMX1Q9H3N1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMX1Q9H3N1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMX1Q9H3N1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMX1Q9H3N1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMX1Q9H3N1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMX1Q9H3N1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMX1Q9H3N1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMX1Q9H3N1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMX1Q9H3N1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMX1Q9H3N1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMX1Q9H3N1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMX1Q9H3N1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMX1Q9H3N1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMX1Q9H3N1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMX1Q9H3N1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMX1Q9H3N1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMX1Q9H3N1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMX1Q9H3N1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMX1Q9H3N1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMX1Q9H3N1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMX1Q9H3N1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMX1Q9H3N1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMX1Q9H3N1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMX1Q9H3N1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMX1Q9H3N1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMX1Q9H3N1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMX1Q9H3N1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMX1Q9H3N1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMX1Q9H3N1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMX1Q9H3N1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMX1Q9H3N1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMX1Q9H3N1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMX1Q9H3N1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMX1Q9H3N1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMX1Q9H3N1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMX1Q9H3N1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMX1Q9H3N1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TMX1Q9H3N1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMX1Q9H3N1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMX1Q9H3N1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMX1Q9H3N1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMX1Q9H3N1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMX1Q9H3N1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMX1Q9H3N1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMX1Q9H3N1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMX1Q9H3N1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TMX1Q9H3N1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMX1Q9H3N1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMX1Q9H3N1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMX1Q9H3N1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMX1Q9H3N1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMX1Q9H3N1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TMX1Q9H3N1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMX1Q9H3N1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMX1Q9H3N1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TMX1Q9H3N1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TMX1Q9H3N1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TMX1Q9H3N1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 203.6 ms