Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2C1

LHX5, LIM/homeobox protein Lhx5, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX5Q9H2C1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LHX5Q9H2C1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LHX5Q9H2C1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LHX5Q9H2C1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LHX5Q9H2C1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LHX5Q9H2C1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LHX5Q9H2C1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LHX5Q9H2C1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LHX5Q9H2C1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LHX5Q9H2C1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LHX5Q9H2C1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LHX5Q9H2C1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LHX5Q9H2C1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LHX5Q9H2C1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LHX5Q9H2C1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LHX5Q9H2C1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LHX5Q9H2C1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LHX5Q9H2C1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LHX5Q9H2C1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LHX5Q9H2C1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LHX5Q9H2C1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LHX5Q9H2C1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LHX5Q9H2C1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LHX5Q9H2C1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LHX5Q9H2C1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LHX5Q9H2C1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LHX5Q9H2C1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LHX5Q9H2C1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LHX5Q9H2C1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LHX5Q9H2C1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LHX5Q9H2C1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LHX5Q9H2C1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LHX5Q9H2C1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LHX5Q9H2C1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LHX5Q9H2C1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LHX5Q9H2C1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LHX5Q9H2C1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LHX5Q9H2C1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LHX5Q9H2C1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LHX5Q9H2C1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LHX5Q9H2C1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LHX5Q9H2C1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LHX5Q9H2C1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LHX5Q9H2C1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LHX5Q9H2C1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LHX5Q9H2C1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LHX5Q9H2C1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LHX5Q9H2C1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LHX5Q9H2C1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LHX5Q9H2C1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LHX5Q9H2C1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LHX5Q9H2C1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LHX5Q9H2C1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LHX5Q9H2C1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LHX5Q9H2C1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LHX5Q9H2C1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LHX5Q9H2C1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LHX5Q9H2C1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LHX5Q9H2C1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LHX5Q9H2C1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LHX5Q9H2C1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LHX5Q9H2C1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LHX5Q9H2C1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LHX5Q9H2C1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LHX5Q9H2C1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LHX5Q9H2C1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LHX5Q9H2C1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LHX5Q9H2C1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LHX5Q9H2C1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LHX5Q9H2C1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LHX5Q9H2C1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LHX5Q9H2C1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LHX5Q9H2C1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LHX5Q9H2C1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LHX5Q9H2C1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LHX5Q9H2C1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LHX5Q9H2C1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LHX5Q9H2C1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LHX5Q9H2C1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LHX5Q9H2C1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LHX5Q9H2C1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LHX5Q9H2C1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LHX5Q9H2C1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LHX5Q9H2C1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LHX5Q9H2C1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
LHX5Q9H2C1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
LHX5Q9H2C1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LHX5Q9H2C1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LHX5Q9H2C1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LHX5Q9H2C1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LHX5Q9H2C1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LHX5Q9H2C1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LHX5Q9H2C1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LHX5Q9H2C1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LHX5Q9H2C1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LHX5Q9H2C1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LHX5Q9H2C1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LHX5Q9H2C1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LHX5Q9H2C1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LHX5Q9H2C1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms