Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR2J2Q9GZM3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR2J2Q9GZM3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR2J2Q9GZM3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR2J2Q9GZM3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR2J2Q9GZM3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR2J2Q9GZM3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR2J2Q9GZM3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR2J2Q9GZM3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR2J2Q9GZM3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR2J2Q9GZM3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR2J2Q9GZM3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR2J2Q9GZM3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR2J2Q9GZM3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR2J2Q9GZM3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR2J2Q9GZM3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR2J2Q9GZM3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR2J2Q9GZM3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR2J2Q9GZM3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR2J2Q9GZM3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR2J2Q9GZM3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR2J2Q9GZM3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR2J2Q9GZM3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR2J2Q9GZM3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR2J2Q9GZM3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR2J2Q9GZM3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR2J2Q9GZM3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR2J2Q9GZM3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR2J2Q9GZM3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR2J2Q9GZM3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
POLR2J2Q9GZM3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR2J2Q9GZM3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR2J2Q9GZM3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR2J2Q9GZM3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR2J2Q9GZM3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR2J2Q9GZM3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR2J2Q9GZM3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR2J2Q9GZM3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR2J2Q9GZM3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR2J2Q9GZM3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR2J2Q9GZM3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR2J2Q9GZM3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR2J2Q9GZM3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR2J2Q9GZM3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR2J2Q9GZM3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR2J2Q9GZM3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR2J2Q9GZM3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR2J2Q9GZM3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR2J2Q9GZM3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR2J2Q9GZM3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR2J2Q9GZM3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR2J2Q9GZM3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR2J2Q9GZM3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR2J2Q9GZM3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR2J2Q9GZM3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR2J2Q9GZM3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR2J2Q9GZM3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR2J2Q9GZM3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR2J2Q9GZM3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR2J2Q9GZM3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR2J2Q9GZM3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR2J2Q9GZM3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR2J2Q9GZM3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR2J2Q9GZM3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR2J2Q9GZM3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR2J2Q9GZM3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR2J2Q9GZM3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR2J2Q9GZM3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR2J2Q9GZM3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR2J2Q9GZM3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR2J2Q9GZM3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR2J2Q9GZM3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR2J2Q9GZM3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR2J2Q9GZM3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR2J2Q9GZM3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR2J2Q9GZM3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR2J2Q9GZM3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR2J2Q9GZM3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR2J2Q9GZM3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR2J2Q9GZM3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR2J2Q9GZM3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR2J2Q9GZM3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR2J2Q9GZM3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR2J2Q9GZM3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR2J2Q9GZM3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR2J2Q9GZM3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR2J2Q9GZM3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR2J2Q9GZM3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR2J2Q9GZM3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR2J2Q9GZM3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR2J2Q9GZM3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR2J2Q9GZM3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR2J2Q9GZM3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR2J2Q9GZM3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR2J2Q9GZM3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR2J2Q9GZM3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR2J2Q9GZM3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR2J2Q9GZM3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR2J2Q9GZM3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR2J2Q9GZM3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 350.9 ms